Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CAPNS2Q96L46 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CAPNS2Q96L46 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CAPNS2Q96L46 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CAPNS2Q96L46 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CAPNS2Q96L46 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CAPNS2Q96L46 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CAPNS2Q96L46 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CAPNS2Q96L46 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CAPNS2Q96L46 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CAPNS2Q96L46 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CAPNS2Q96L46 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CAPNS2Q96L46 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CAPNS2Q96L46 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CAPNS2Q96L46 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CAPNS2Q96L46 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
CAPNS2Q96L46 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CAPNS2Q96L46 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CAPNS2Q96L46 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CAPNS2Q96L46 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CAPNS2Q96L46 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CAPNS2Q96L46 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CAPNS2Q96L46 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CAPNS2Q96L46 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CAPNS2Q96L46 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CAPNS2Q96L46 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CAPNS2Q96L46 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CAPNS2Q96L46 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CAPNS2Q96L46 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CAPNS2Q96L46 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CAPNS2Q96L46 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CAPNS2Q96L46 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CAPNS2Q96L46 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
CAPNS2Q96L46 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CAPNS2Q96L46 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CAPNS2Q96L46 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CAPNS2Q96L46 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CAPNS2Q96L46 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CAPNS2Q96L46 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
CAPNS2Q96L46 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
CAPNS2Q96L46 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CAPNS2Q96L46 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CAPNS2Q96L46 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CAPNS2Q96L46 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
CAPNS2Q96L46 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
CAPNS2Q96L46 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CAPNS2Q96L46 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CAPNS2Q96L46 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CAPNS2Q96L46 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CAPNS2Q96L46 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CAPNS2Q96L46 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CAPNS2Q96L46 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CAPNS2Q96L46 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CAPNS2Q96L46 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CAPNS2Q96L46 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CAPNS2Q96L46 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CAPNS2Q96L46 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CAPNS2Q96L46 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
CAPNS2Q96L46 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CAPNS2Q96L46 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
CAPNS2Q96L46 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CAPNS2Q96L46 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CAPNS2Q96L46 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CAPNS2Q96L46 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CAPNS2Q96L46 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CAPNS2Q96L46 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CAPNS2Q96L46 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CAPNS2Q96L46 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CAPNS2Q96L46 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CAPNS2Q96L46 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CAPNS2Q96L46 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CAPNS2Q96L46 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CAPNS2Q96L46 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CAPNS2Q96L46 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CAPNS2Q96L46 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CAPNS2Q96L46 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CAPNS2Q96L46 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
CAPNS2Q96L46 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CAPNS2Q96L46 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CAPNS2Q96L46 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CAPNS2Q96L46 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CAPNS2Q96L46 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CAPNS2Q96L46 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CAPNS2Q96L46 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
CAPNS2Q96L46 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CAPNS2Q96L46 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
CAPNS2Q96L46 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CAPNS2Q96L46 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CAPNS2Q96L46 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CAPNS2Q96L46 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CAPNS2Q96L46 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CAPNS2Q96L46 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
CAPNS2Q96L46 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CAPNS2Q96L46 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CAPNS2Q96L46 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CAPNS2Q96L46 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CAPNS2Q96L46 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CAPNS2Q96L46 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CAPNS2Q96L46 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CAPNS2Q96L46 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms