Protein–RNA interactions for Protein: Q96L34

MARK4, MAP/microtubule affinity-regulating kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARK4Q96L34 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MARK4Q96L34 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MARK4Q96L34 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MARK4Q96L34 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MARK4Q96L34 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MARK4Q96L34 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MARK4Q96L34 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MARK4Q96L34 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MARK4Q96L34 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MARK4Q96L34 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
MARK4Q96L34 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MARK4Q96L34 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MARK4Q96L34 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MARK4Q96L34 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MARK4Q96L34 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MARK4Q96L34 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MARK4Q96L34 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MARK4Q96L34 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MARK4Q96L34 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MARK4Q96L34 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MARK4Q96L34 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MARK4Q96L34 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MARK4Q96L34 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MARK4Q96L34 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MARK4Q96L34 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MARK4Q96L34 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MARK4Q96L34 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MARK4Q96L34 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MARK4Q96L34 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MARK4Q96L34 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MARK4Q96L34 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MARK4Q96L34 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MARK4Q96L34 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MARK4Q96L34 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MARK4Q96L34 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MARK4Q96L34 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MARK4Q96L34 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MARK4Q96L34 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MARK4Q96L34 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MARK4Q96L34 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MARK4Q96L34 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MARK4Q96L34 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MARK4Q96L34 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MARK4Q96L34 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MARK4Q96L34 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MARK4Q96L34 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MARK4Q96L34 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MARK4Q96L34 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MARK4Q96L34 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MARK4Q96L34 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MARK4Q96L34 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MARK4Q96L34 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MARK4Q96L34 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MARK4Q96L34 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MARK4Q96L34 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MARK4Q96L34 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MARK4Q96L34 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MARK4Q96L34 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MARK4Q96L34 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MARK4Q96L34 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MARK4Q96L34 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MARK4Q96L34 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MARK4Q96L34 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MARK4Q96L34 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MARK4Q96L34 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MARK4Q96L34 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MARK4Q96L34 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MARK4Q96L34 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MARK4Q96L34 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MARK4Q96L34 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MARK4Q96L34 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MARK4Q96L34 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MARK4Q96L34 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MARK4Q96L34 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MARK4Q96L34 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MARK4Q96L34 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MARK4Q96L34 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MARK4Q96L34 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MARK4Q96L34 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MARK4Q96L34 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MARK4Q96L34 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MARK4Q96L34 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MARK4Q96L34 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MARK4Q96L34 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MARK4Q96L34 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MARK4Q96L34 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MARK4Q96L34 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
MARK4Q96L34 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MARK4Q96L34 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MARK4Q96L34 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MARK4Q96L34 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MARK4Q96L34 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MARK4Q96L34 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MARK4Q96L34 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MARK4Q96L34 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MARK4Q96L34 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MARK4Q96L34 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MARK4Q96L34 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MARK4Q96L34 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MARK4Q96L34 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms