Protein–RNA interactions for Protein: Q96JT2

SLC45A3, Solute carrier family 45 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC45A3Q96JT2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC45A3Q96JT2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC45A3Q96JT2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC45A3Q96JT2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC45A3Q96JT2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC45A3Q96JT2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC45A3Q96JT2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC45A3Q96JT2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC45A3Q96JT2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC45A3Q96JT2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC45A3Q96JT2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC45A3Q96JT2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC45A3Q96JT2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC45A3Q96JT2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC45A3Q96JT2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC45A3Q96JT2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC45A3Q96JT2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC45A3Q96JT2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC45A3Q96JT2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC45A3Q96JT2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC45A3Q96JT2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC45A3Q96JT2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC45A3Q96JT2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC45A3Q96JT2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC45A3Q96JT2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC45A3Q96JT2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC45A3Q96JT2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC45A3Q96JT2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC45A3Q96JT2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC45A3Q96JT2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC45A3Q96JT2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC45A3Q96JT2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC45A3Q96JT2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC45A3Q96JT2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC45A3Q96JT2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC45A3Q96JT2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC45A3Q96JT2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC45A3Q96JT2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLC45A3Q96JT2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC45A3Q96JT2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC45A3Q96JT2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC45A3Q96JT2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC45A3Q96JT2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC45A3Q96JT2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC45A3Q96JT2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC45A3Q96JT2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC45A3Q96JT2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC45A3Q96JT2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC45A3Q96JT2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC45A3Q96JT2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC45A3Q96JT2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC45A3Q96JT2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC45A3Q96JT2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC45A3Q96JT2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC45A3Q96JT2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC45A3Q96JT2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC45A3Q96JT2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC45A3Q96JT2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC45A3Q96JT2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC45A3Q96JT2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC45A3Q96JT2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC45A3Q96JT2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC45A3Q96JT2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC45A3Q96JT2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC45A3Q96JT2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC45A3Q96JT2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC45A3Q96JT2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC45A3Q96JT2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC45A3Q96JT2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC45A3Q96JT2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC45A3Q96JT2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC45A3Q96JT2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC45A3Q96JT2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC45A3Q96JT2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC45A3Q96JT2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC45A3Q96JT2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC45A3Q96JT2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SLC45A3Q96JT2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SLC45A3Q96JT2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC45A3Q96JT2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC45A3Q96JT2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC45A3Q96JT2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC45A3Q96JT2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC45A3Q96JT2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC45A3Q96JT2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC45A3Q96JT2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC45A3Q96JT2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC45A3Q96JT2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC45A3Q96JT2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC45A3Q96JT2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC45A3Q96JT2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC45A3Q96JT2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC45A3Q96JT2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC45A3Q96JT2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC45A3Q96JT2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC45A3Q96JT2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC45A3Q96JT2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC45A3Q96JT2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC45A3Q96JT2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC45A3Q96JT2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 160.8 ms