Protein–RNA interactions for Protein: Q96JJ6

JPH4, Junctophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JPH4Q96JJ6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.11■■■■■ 4.33
JPH4Q96JJ6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC42.11■■■■■ 4.33
JPH4Q96JJ6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC42.11■■■■■ 4.33
JPH4Q96JJ6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC42.1■■■■■ 4.33
JPH4Q96JJ6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
JPH4Q96JJ6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC42.09■■■■■ 4.33
JPH4Q96JJ6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
JPH4Q96JJ6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
JPH4Q96JJ6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
JPH4Q96JJ6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC42.08■■■■■ 4.33
JPH4Q96JJ6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC42.06■■■■■ 4.32
JPH4Q96JJ6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.06■■■■■ 4.32
JPH4Q96JJ6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
JPH4Q96JJ6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.05■■■■■ 4.32
JPH4Q96JJ6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
JPH4Q96JJ6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
JPH4Q96JJ6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
JPH4Q96JJ6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
JPH4Q96JJ6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC42.03■■■■■ 4.32
JPH4Q96JJ6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC42.02■■■■■ 4.32
JPH4Q96JJ6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC42.02■■■■■ 4.32
JPH4Q96JJ6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
JPH4Q96JJ6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC42.01■■■■■ 4.32
JPH4Q96JJ6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
JPH4Q96JJ6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
JPH4Q96JJ6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
JPH4Q96JJ6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
JPH4Q96JJ6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
JPH4Q96JJ6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.98■■■■■ 4.31
JPH4Q96JJ6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC41.98■■■■■ 4.31
JPH4Q96JJ6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
JPH4Q96JJ6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC41.97■■■■■ 4.31
JPH4Q96JJ6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
JPH4Q96JJ6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
JPH4Q96JJ6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC41.95■■■■■ 4.31
JPH4Q96JJ6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC41.95■■■■■ 4.31
JPH4Q96JJ6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
JPH4Q96JJ6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC41.95■■■■■ 4.31
JPH4Q96JJ6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
JPH4Q96JJ6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC41.94■■■■■ 4.3
JPH4Q96JJ6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC41.93■■■■■ 4.3
JPH4Q96JJ6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC41.93■■■■■ 4.3
JPH4Q96JJ6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
JPH4Q96JJ6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
JPH4Q96JJ6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC41.92■■■■■ 4.3
JPH4Q96JJ6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
JPH4Q96JJ6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
JPH4Q96JJ6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.91■■■■■ 4.3
JPH4Q96JJ6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
JPH4Q96JJ6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC41.9■■■■■ 4.3
JPH4Q96JJ6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
JPH4Q96JJ6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC41.89■■■■■ 4.3
JPH4Q96JJ6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC41.89■■■■■ 4.3
JPH4Q96JJ6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC41.87■■■■■ 4.29
JPH4Q96JJ6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.85■■■■■ 4.29
JPH4Q96JJ6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC41.85■■■■■ 4.29
JPH4Q96JJ6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
JPH4Q96JJ6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
JPH4Q96JJ6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
JPH4Q96JJ6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC41.83■■■■■ 4.29
JPH4Q96JJ6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
JPH4Q96JJ6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
JPH4Q96JJ6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.83■■■■■ 4.29
JPH4Q96JJ6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
JPH4Q96JJ6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
JPH4Q96JJ6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
JPH4Q96JJ6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC41.81■■■■■ 4.28
JPH4Q96JJ6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
JPH4Q96JJ6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC41.81■■■■■ 4.28
JPH4Q96JJ6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC41.81■■■■■ 4.28
JPH4Q96JJ6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
JPH4Q96JJ6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
JPH4Q96JJ6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
JPH4Q96JJ6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC41.77■■■■■ 4.28
JPH4Q96JJ6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
JPH4Q96JJ6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
JPH4Q96JJ6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC41.76■■■■■ 4.28
JPH4Q96JJ6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
JPH4Q96JJ6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC41.76■■■■■ 4.28
JPH4Q96JJ6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC41.76■■■■■ 4.28
JPH4Q96JJ6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
JPH4Q96JJ6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.75■■■■■ 4.27
JPH4Q96JJ6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
JPH4Q96JJ6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
JPH4Q96JJ6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC41.73■■■■■ 4.27
JPH4Q96JJ6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
JPH4Q96JJ6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
JPH4Q96JJ6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
JPH4Q96JJ6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC41.72■■■■■ 4.27
JPH4Q96JJ6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC41.71■■■■■ 4.27
JPH4Q96JJ6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC41.71■■■■■ 4.27
JPH4Q96JJ6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
JPH4Q96JJ6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC41.7■■■■■ 4.27
JPH4Q96JJ6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC41.7■■■■■ 4.27
JPH4Q96JJ6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
JPH4Q96JJ6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
JPH4Q96JJ6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
JPH4Q96JJ6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
JPH4Q96JJ6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC41.67■■■■■ 4.26
JPH4Q96JJ6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms