Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG8

MAGED4, Melanoma-associated antigen D4, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGED4Q96JG8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MAGED4Q96JG8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MAGED4Q96JG8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MAGED4Q96JG8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MAGED4Q96JG8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MAGED4Q96JG8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MAGED4Q96JG8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MAGED4Q96JG8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MAGED4Q96JG8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MAGED4Q96JG8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MAGED4Q96JG8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MAGED4Q96JG8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MAGED4Q96JG8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MAGED4Q96JG8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MAGED4Q96JG8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MAGED4Q96JG8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MAGED4Q96JG8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MAGED4Q96JG8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MAGED4Q96JG8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MAGED4Q96JG8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MAGED4Q96JG8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MAGED4Q96JG8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MAGED4Q96JG8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MAGED4Q96JG8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MAGED4Q96JG8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MAGED4Q96JG8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAGED4Q96JG8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAGED4Q96JG8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAGED4Q96JG8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAGED4Q96JG8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAGED4Q96JG8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAGED4Q96JG8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAGED4Q96JG8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MAGED4Q96JG8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAGED4Q96JG8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MAGED4Q96JG8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MAGED4Q96JG8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MAGED4Q96JG8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MAGED4Q96JG8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MAGED4Q96JG8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MAGED4Q96JG8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MAGED4Q96JG8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MAGED4Q96JG8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MAGED4Q96JG8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MAGED4Q96JG8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MAGED4Q96JG8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MAGED4Q96JG8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAGED4Q96JG8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAGED4Q96JG8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAGED4Q96JG8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAGED4Q96JG8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MAGED4Q96JG8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MAGED4Q96JG8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MAGED4Q96JG8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MAGED4Q96JG8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAGED4Q96JG8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAGED4Q96JG8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAGED4Q96JG8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAGED4Q96JG8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAGED4Q96JG8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MAGED4Q96JG8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MAGED4Q96JG8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MAGED4Q96JG8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MAGED4Q96JG8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MAGED4Q96JG8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAGED4Q96JG8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAGED4Q96JG8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAGED4Q96JG8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAGED4Q96JG8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAGED4Q96JG8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MAGED4Q96JG8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MAGED4Q96JG8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MAGED4Q96JG8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MAGED4Q96JG8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAGED4Q96JG8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAGED4Q96JG8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAGED4Q96JG8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAGED4Q96JG8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAGED4Q96JG8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAGED4Q96JG8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAGED4Q96JG8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAGED4Q96JG8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAGED4Q96JG8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MAGED4Q96JG8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MAGED4Q96JG8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAGED4Q96JG8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAGED4Q96JG8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAGED4Q96JG8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MAGED4Q96JG8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MAGED4Q96JG8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MAGED4Q96JG8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MAGED4Q96JG8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MAGED4Q96JG8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MAGED4Q96JG8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MAGED4Q96JG8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MAGED4Q96JG8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MAGED4Q96JG8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MAGED4Q96JG8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MAGED4Q96JG8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MAGED4Q96JG8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.5 ms