Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC4

ZNF479, Zinc finger protein 479, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF479Q96JC4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF479Q96JC4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF479Q96JC4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF479Q96JC4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF479Q96JC4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF479Q96JC4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF479Q96JC4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF479Q96JC4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF479Q96JC4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF479Q96JC4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF479Q96JC4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF479Q96JC4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF479Q96JC4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF479Q96JC4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF479Q96JC4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF479Q96JC4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF479Q96JC4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF479Q96JC4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF479Q96JC4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF479Q96JC4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF479Q96JC4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF479Q96JC4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF479Q96JC4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF479Q96JC4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF479Q96JC4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF479Q96JC4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF479Q96JC4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF479Q96JC4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF479Q96JC4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF479Q96JC4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF479Q96JC4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF479Q96JC4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF479Q96JC4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF479Q96JC4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF479Q96JC4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF479Q96JC4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF479Q96JC4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF479Q96JC4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF479Q96JC4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF479Q96JC4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF479Q96JC4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF479Q96JC4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF479Q96JC4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF479Q96JC4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF479Q96JC4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF479Q96JC4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF479Q96JC4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF479Q96JC4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF479Q96JC4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF479Q96JC4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF479Q96JC4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF479Q96JC4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF479Q96JC4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF479Q96JC4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF479Q96JC4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF479Q96JC4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF479Q96JC4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF479Q96JC4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF479Q96JC4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF479Q96JC4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF479Q96JC4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF479Q96JC4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF479Q96JC4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF479Q96JC4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF479Q96JC4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF479Q96JC4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF479Q96JC4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF479Q96JC4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF479Q96JC4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF479Q96JC4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF479Q96JC4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF479Q96JC4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF479Q96JC4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF479Q96JC4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF479Q96JC4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF479Q96JC4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF479Q96JC4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF479Q96JC4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF479Q96JC4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF479Q96JC4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF479Q96JC4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF479Q96JC4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF479Q96JC4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF479Q96JC4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF479Q96JC4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF479Q96JC4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF479Q96JC4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF479Q96JC4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF479Q96JC4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF479Q96JC4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF479Q96JC4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF479Q96JC4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF479Q96JC4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF479Q96JC4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF479Q96JC4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF479Q96JC4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF479Q96JC4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF479Q96JC4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF479Q96JC4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF479Q96JC4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms