Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CELF6Q96J87 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CELF6Q96J87 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CELF6Q96J87 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CELF6Q96J87 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CELF6Q96J87 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CELF6Q96J87 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CELF6Q96J87 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CELF6Q96J87 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CELF6Q96J87 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CELF6Q96J87 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CELF6Q96J87 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CELF6Q96J87 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CELF6Q96J87 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CELF6Q96J87 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CELF6Q96J87 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CELF6Q96J87 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CELF6Q96J87 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CELF6Q96J87 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CELF6Q96J87 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CELF6Q96J87 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CELF6Q96J87 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CELF6Q96J87 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CELF6Q96J87 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CELF6Q96J87 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CELF6Q96J87 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CELF6Q96J87 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CELF6Q96J87 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CELF6Q96J87 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CELF6Q96J87 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CELF6Q96J87 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CELF6Q96J87 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CELF6Q96J87 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CELF6Q96J87 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CELF6Q96J87 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CELF6Q96J87 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CELF6Q96J87 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CELF6Q96J87 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CELF6Q96J87 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CELF6Q96J87 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CELF6Q96J87 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CELF6Q96J87 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CELF6Q96J87 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CELF6Q96J87 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CELF6Q96J87 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CELF6Q96J87 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CELF6Q96J87 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CELF6Q96J87 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CELF6Q96J87 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CELF6Q96J87 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CELF6Q96J87 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CELF6Q96J87 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CELF6Q96J87 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CELF6Q96J87 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CELF6Q96J87 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CELF6Q96J87 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CELF6Q96J87 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CELF6Q96J87 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CELF6Q96J87 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CELF6Q96J87 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CELF6Q96J87 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CELF6Q96J87 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CELF6Q96J87 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CELF6Q96J87 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CELF6Q96J87 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CELF6Q96J87 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CELF6Q96J87 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CELF6Q96J87 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CELF6Q96J87 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CELF6Q96J87 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CELF6Q96J87 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CELF6Q96J87 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CELF6Q96J87 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CELF6Q96J87 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CELF6Q96J87 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CELF6Q96J87 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CELF6Q96J87 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CELF6Q96J87 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CELF6Q96J87 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CELF6Q96J87 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CELF6Q96J87 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CELF6Q96J87 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CELF6Q96J87 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CELF6Q96J87 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CELF6Q96J87 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CELF6Q96J87 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CELF6Q96J87 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CELF6Q96J87 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CELF6Q96J87 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CELF6Q96J87 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CELF6Q96J87 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CELF6Q96J87 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CELF6Q96J87 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CELF6Q96J87 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CELF6Q96J87 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CELF6Q96J87 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CELF6Q96J87 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CELF6Q96J87 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CELF6Q96J87 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CELF6Q96J87 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms