Protein–RNA interactions for Protein: Q96H12

MSANTD3, Myb/SANT-like DNA-binding domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSANTD3Q96H12 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MSANTD3Q96H12 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MSANTD3Q96H12 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MSANTD3Q96H12 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MSANTD3Q96H12 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MSANTD3Q96H12 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MSANTD3Q96H12 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MSANTD3Q96H12 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
MSANTD3Q96H12 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MSANTD3Q96H12 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MSANTD3Q96H12 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MSANTD3Q96H12 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
MSANTD3Q96H12 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MSANTD3Q96H12 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MSANTD3Q96H12 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MSANTD3Q96H12 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MSANTD3Q96H12 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
MSANTD3Q96H12 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MSANTD3Q96H12 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MSANTD3Q96H12 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MSANTD3Q96H12 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MSANTD3Q96H12 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MSANTD3Q96H12 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MSANTD3Q96H12 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MSANTD3Q96H12 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MSANTD3Q96H12 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MSANTD3Q96H12 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MSANTD3Q96H12 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
MSANTD3Q96H12 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MSANTD3Q96H12 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MSANTD3Q96H12 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MSANTD3Q96H12 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MSANTD3Q96H12 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MSANTD3Q96H12 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MSANTD3Q96H12 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MSANTD3Q96H12 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MSANTD3Q96H12 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MSANTD3Q96H12 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MSANTD3Q96H12 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MSANTD3Q96H12 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
MSANTD3Q96H12 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MSANTD3Q96H12 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MSANTD3Q96H12 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MSANTD3Q96H12 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
MSANTD3Q96H12 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MSANTD3Q96H12 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MSANTD3Q96H12 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MSANTD3Q96H12 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MSANTD3Q96H12 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MSANTD3Q96H12 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MSANTD3Q96H12 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MSANTD3Q96H12 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MSANTD3Q96H12 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MSANTD3Q96H12 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MSANTD3Q96H12 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MSANTD3Q96H12 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MSANTD3Q96H12 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MSANTD3Q96H12 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MSANTD3Q96H12 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MSANTD3Q96H12 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MSANTD3Q96H12 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MSANTD3Q96H12 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MSANTD3Q96H12 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MSANTD3Q96H12 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MSANTD3Q96H12 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
MSANTD3Q96H12 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MSANTD3Q96H12 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MSANTD3Q96H12 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
MSANTD3Q96H12 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MSANTD3Q96H12 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MSANTD3Q96H12 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MSANTD3Q96H12 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MSANTD3Q96H12 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MSANTD3Q96H12 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MSANTD3Q96H12 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
MSANTD3Q96H12 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
MSANTD3Q96H12 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MSANTD3Q96H12 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MSANTD3Q96H12 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MSANTD3Q96H12 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
MSANTD3Q96H12 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MSANTD3Q96H12 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MSANTD3Q96H12 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MSANTD3Q96H12 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MSANTD3Q96H12 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MSANTD3Q96H12 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
MSANTD3Q96H12 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
MSANTD3Q96H12 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MSANTD3Q96H12 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MSANTD3Q96H12 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MSANTD3Q96H12 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
MSANTD3Q96H12 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MSANTD3Q96H12 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MSANTD3Q96H12 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MSANTD3Q96H12 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MSANTD3Q96H12 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MSANTD3Q96H12 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MSANTD3Q96H12 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
MSANTD3Q96H12 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MSANTD3Q96H12 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms