Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
BCANQ96GW7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
BCANQ96GW7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
BCANQ96GW7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
BCANQ96GW7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC37.36■■■■□ 3.57
BCANQ96GW7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
BCANQ96GW7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
BCANQ96GW7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
BCANQ96GW7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC37.35■■■■□ 3.57
BCANQ96GW7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.35■■■■□ 3.57
BCANQ96GW7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
BCANQ96GW7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
BCANQ96GW7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
BCANQ96GW7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
BCANQ96GW7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
BCANQ96GW7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
BCANQ96GW7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
BCANQ96GW7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
BCANQ96GW7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
BCANQ96GW7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
BCANQ96GW7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
BCANQ96GW7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
BCANQ96GW7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
BCANQ96GW7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
BCANQ96GW7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
BCANQ96GW7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
BCANQ96GW7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
BCANQ96GW7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
BCANQ96GW7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC37.3■■■■□ 3.56
BCANQ96GW7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
BCANQ96GW7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
BCANQ96GW7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
BCANQ96GW7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
BCANQ96GW7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
BCANQ96GW7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
BCANQ96GW7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
BCANQ96GW7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
BCANQ96GW7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
BCANQ96GW7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
BCANQ96GW7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
BCANQ96GW7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.25■■■■□ 3.55
BCANQ96GW7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
BCANQ96GW7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
BCANQ96GW7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
BCANQ96GW7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
BCANQ96GW7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
BCANQ96GW7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
BCANQ96GW7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
BCANQ96GW7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
BCANQ96GW7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
BCANQ96GW7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
BCANQ96GW7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
BCANQ96GW7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
BCANQ96GW7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
BCANQ96GW7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
BCANQ96GW7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
BCANQ96GW7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
BCANQ96GW7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
BCANQ96GW7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
BCANQ96GW7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
BCANQ96GW7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
BCANQ96GW7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
BCANQ96GW7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.16■■■■□ 3.54
BCANQ96GW7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC37.16■■■■□ 3.54
BCANQ96GW7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
BCANQ96GW7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
BCANQ96GW7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC37.15■■■■□ 3.54
BCANQ96GW7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
BCANQ96GW7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
BCANQ96GW7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
BCANQ96GW7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
BCANQ96GW7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
BCANQ96GW7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
BCANQ96GW7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
BCANQ96GW7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
BCANQ96GW7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC37.11■■■■□ 3.53
BCANQ96GW7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
BCANQ96GW7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
BCANQ96GW7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
BCANQ96GW7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
BCANQ96GW7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
BCANQ96GW7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
BCANQ96GW7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
BCANQ96GW7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
BCANQ96GW7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
BCANQ96GW7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
BCANQ96GW7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC37.01■■■■□ 3.51
BCANQ96GW7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.51
BCANQ96GW7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC37■■■■□ 3.51
BCANQ96GW7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
BCANQ96GW7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
BCANQ96GW7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
BCANQ96GW7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC37■■■■□ 3.51
BCANQ96GW7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
BCANQ96GW7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
BCANQ96GW7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
BCANQ96GW7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
BCANQ96GW7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
BCANQ96GW7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
BCANQ96GW7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms