Protein–RNA interactions for Protein: Q96FE5

LINGO1, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO1Q96FE5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LINGO1Q96FE5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LINGO1Q96FE5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LINGO1Q96FE5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LINGO1Q96FE5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LINGO1Q96FE5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LINGO1Q96FE5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LINGO1Q96FE5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LINGO1Q96FE5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LINGO1Q96FE5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LINGO1Q96FE5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LINGO1Q96FE5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LINGO1Q96FE5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LINGO1Q96FE5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LINGO1Q96FE5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LINGO1Q96FE5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LINGO1Q96FE5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LINGO1Q96FE5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LINGO1Q96FE5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LINGO1Q96FE5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LINGO1Q96FE5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LINGO1Q96FE5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LINGO1Q96FE5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LINGO1Q96FE5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LINGO1Q96FE5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LINGO1Q96FE5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LINGO1Q96FE5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LINGO1Q96FE5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LINGO1Q96FE5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LINGO1Q96FE5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
LINGO1Q96FE5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
LINGO1Q96FE5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LINGO1Q96FE5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LINGO1Q96FE5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LINGO1Q96FE5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LINGO1Q96FE5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LINGO1Q96FE5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LINGO1Q96FE5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LINGO1Q96FE5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LINGO1Q96FE5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LINGO1Q96FE5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LINGO1Q96FE5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LINGO1Q96FE5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LINGO1Q96FE5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LINGO1Q96FE5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LINGO1Q96FE5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LINGO1Q96FE5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LINGO1Q96FE5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LINGO1Q96FE5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LINGO1Q96FE5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LINGO1Q96FE5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LINGO1Q96FE5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LINGO1Q96FE5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LINGO1Q96FE5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LINGO1Q96FE5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LINGO1Q96FE5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LINGO1Q96FE5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LINGO1Q96FE5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LINGO1Q96FE5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LINGO1Q96FE5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LINGO1Q96FE5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LINGO1Q96FE5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LINGO1Q96FE5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LINGO1Q96FE5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LINGO1Q96FE5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LINGO1Q96FE5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LINGO1Q96FE5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LINGO1Q96FE5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LINGO1Q96FE5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LINGO1Q96FE5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LINGO1Q96FE5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LINGO1Q96FE5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LINGO1Q96FE5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LINGO1Q96FE5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LINGO1Q96FE5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LINGO1Q96FE5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LINGO1Q96FE5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LINGO1Q96FE5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LINGO1Q96FE5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LINGO1Q96FE5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LINGO1Q96FE5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
LINGO1Q96FE5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LINGO1Q96FE5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
LINGO1Q96FE5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
LINGO1Q96FE5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LINGO1Q96FE5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LINGO1Q96FE5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LINGO1Q96FE5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LINGO1Q96FE5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LINGO1Q96FE5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LINGO1Q96FE5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LINGO1Q96FE5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LINGO1Q96FE5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LINGO1Q96FE5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LINGO1Q96FE5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LINGO1Q96FE5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LINGO1Q96FE5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LINGO1Q96FE5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LINGO1Q96FE5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LINGO1Q96FE5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.9 ms