Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTERF3Q96E29 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MTERF3Q96E29 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MTERF3Q96E29 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTERF3Q96E29 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTERF3Q96E29 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTERF3Q96E29 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTERF3Q96E29 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTERF3Q96E29 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTERF3Q96E29 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MTERF3Q96E29 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTERF3Q96E29 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTERF3Q96E29 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTERF3Q96E29 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTERF3Q96E29 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTERF3Q96E29 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTERF3Q96E29 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTERF3Q96E29 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTERF3Q96E29 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTERF3Q96E29 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTERF3Q96E29 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTERF3Q96E29 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTERF3Q96E29 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTERF3Q96E29 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTERF3Q96E29 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTERF3Q96E29 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTERF3Q96E29 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTERF3Q96E29 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTERF3Q96E29 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTERF3Q96E29 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTERF3Q96E29 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTERF3Q96E29 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTERF3Q96E29 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTERF3Q96E29 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTERF3Q96E29 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MTERF3Q96E29 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTERF3Q96E29 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTERF3Q96E29 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTERF3Q96E29 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MTERF3Q96E29 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTERF3Q96E29 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTERF3Q96E29 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTERF3Q96E29 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTERF3Q96E29 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTERF3Q96E29 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTERF3Q96E29 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTERF3Q96E29 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTERF3Q96E29 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTERF3Q96E29 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTERF3Q96E29 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MTERF3Q96E29 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTERF3Q96E29 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MTERF3Q96E29 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTERF3Q96E29 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTERF3Q96E29 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTERF3Q96E29 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTERF3Q96E29 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTERF3Q96E29 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTERF3Q96E29 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTERF3Q96E29 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTERF3Q96E29 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTERF3Q96E29 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTERF3Q96E29 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTERF3Q96E29 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTERF3Q96E29 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTERF3Q96E29 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTERF3Q96E29 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MTERF3Q96E29 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTERF3Q96E29 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTERF3Q96E29 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTERF3Q96E29 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MTERF3Q96E29 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTERF3Q96E29 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTERF3Q96E29 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTERF3Q96E29 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTERF3Q96E29 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTERF3Q96E29 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTERF3Q96E29 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTERF3Q96E29 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTERF3Q96E29 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTERF3Q96E29 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTERF3Q96E29 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTERF3Q96E29 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MTERF3Q96E29 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MTERF3Q96E29 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MTERF3Q96E29 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MTERF3Q96E29 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MTERF3Q96E29 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTERF3Q96E29 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTERF3Q96E29 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTERF3Q96E29 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MTERF3Q96E29 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTERF3Q96E29 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MTERF3Q96E29 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTERF3Q96E29 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTERF3Q96E29 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTERF3Q96E29 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTERF3Q96E29 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTERF3Q96E29 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTERF3Q96E29 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms