Protein–RNA interactions for Protein: Q96DN0

ERP27, Endoplasmic reticulum resident protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERP27Q96DN0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERP27Q96DN0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERP27Q96DN0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERP27Q96DN0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERP27Q96DN0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
ERP27Q96DN0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERP27Q96DN0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERP27Q96DN0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERP27Q96DN0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERP27Q96DN0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERP27Q96DN0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERP27Q96DN0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERP27Q96DN0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERP27Q96DN0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERP27Q96DN0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERP27Q96DN0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERP27Q96DN0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERP27Q96DN0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERP27Q96DN0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERP27Q96DN0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERP27Q96DN0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERP27Q96DN0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERP27Q96DN0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERP27Q96DN0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERP27Q96DN0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERP27Q96DN0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERP27Q96DN0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERP27Q96DN0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ERP27Q96DN0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERP27Q96DN0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERP27Q96DN0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERP27Q96DN0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERP27Q96DN0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERP27Q96DN0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERP27Q96DN0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERP27Q96DN0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERP27Q96DN0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERP27Q96DN0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERP27Q96DN0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERP27Q96DN0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERP27Q96DN0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERP27Q96DN0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERP27Q96DN0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERP27Q96DN0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERP27Q96DN0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERP27Q96DN0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERP27Q96DN0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERP27Q96DN0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERP27Q96DN0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERP27Q96DN0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERP27Q96DN0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERP27Q96DN0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERP27Q96DN0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERP27Q96DN0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERP27Q96DN0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERP27Q96DN0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERP27Q96DN0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERP27Q96DN0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERP27Q96DN0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERP27Q96DN0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ERP27Q96DN0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ERP27Q96DN0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERP27Q96DN0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERP27Q96DN0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERP27Q96DN0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERP27Q96DN0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERP27Q96DN0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERP27Q96DN0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERP27Q96DN0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ERP27Q96DN0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERP27Q96DN0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERP27Q96DN0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERP27Q96DN0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERP27Q96DN0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERP27Q96DN0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERP27Q96DN0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ERP27Q96DN0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ERP27Q96DN0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ERP27Q96DN0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ERP27Q96DN0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERP27Q96DN0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERP27Q96DN0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERP27Q96DN0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERP27Q96DN0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERP27Q96DN0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERP27Q96DN0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERP27Q96DN0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERP27Q96DN0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERP27Q96DN0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERP27Q96DN0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERP27Q96DN0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERP27Q96DN0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ERP27Q96DN0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERP27Q96DN0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERP27Q96DN0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERP27Q96DN0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERP27Q96DN0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERP27Q96DN0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERP27Q96DN0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERP27Q96DN0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms