Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC47Q96A33 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC47Q96A33 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC47Q96A33 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC47Q96A33 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC47Q96A33 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC47Q96A33 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC47Q96A33 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC47Q96A33 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC47Q96A33 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC47Q96A33 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC47Q96A33 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC47Q96A33 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC47Q96A33 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC47Q96A33 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC47Q96A33 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC47Q96A33 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC47Q96A33 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC47Q96A33 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC47Q96A33 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC47Q96A33 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC47Q96A33 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC47Q96A33 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC47Q96A33 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC47Q96A33 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC47Q96A33 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC47Q96A33 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC47Q96A33 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC47Q96A33 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC47Q96A33 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC47Q96A33 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC47Q96A33 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC47Q96A33 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC47Q96A33 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC47Q96A33 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC47Q96A33 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC47Q96A33 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC47Q96A33 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC47Q96A33 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC47Q96A33 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC47Q96A33 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC47Q96A33 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC47Q96A33 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC47Q96A33 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC47Q96A33 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC47Q96A33 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC47Q96A33 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC47Q96A33 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC47Q96A33 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC47Q96A33 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC47Q96A33 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC47Q96A33 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC47Q96A33 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC47Q96A33 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC47Q96A33 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC47Q96A33 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC47Q96A33 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC47Q96A33 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC47Q96A33 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC47Q96A33 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC47Q96A33 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC47Q96A33 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC47Q96A33 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC47Q96A33 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC47Q96A33 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC47Q96A33 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC47Q96A33 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC47Q96A33 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC47Q96A33 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC47Q96A33 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC47Q96A33 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC47Q96A33 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC47Q96A33 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC47Q96A33 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC47Q96A33 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC47Q96A33 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC47Q96A33 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC47Q96A33 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC47Q96A33 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC47Q96A33 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC47Q96A33 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CCDC47Q96A33 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CCDC47Q96A33 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC47Q96A33 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC47Q96A33 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC47Q96A33 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC47Q96A33 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC47Q96A33 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC47Q96A33 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC47Q96A33 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC47Q96A33 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC47Q96A33 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC47Q96A33 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC47Q96A33 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC47Q96A33 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC47Q96A33 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC47Q96A33 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC47Q96A33 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC47Q96A33 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC47Q96A33 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms