Protein–RNA interactions for Protein: Q92901

RPL3L, 60S ribosomal protein L3-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL3LQ92901 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPL3LQ92901 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPL3LQ92901 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPL3LQ92901 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPL3LQ92901 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RPL3LQ92901 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPL3LQ92901 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPL3LQ92901 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPL3LQ92901 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPL3LQ92901 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPL3LQ92901 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPL3LQ92901 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPL3LQ92901 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RPL3LQ92901 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RPL3LQ92901 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPL3LQ92901 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPL3LQ92901 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPL3LQ92901 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPL3LQ92901 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPL3LQ92901 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPL3LQ92901 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPL3LQ92901 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPL3LQ92901 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPL3LQ92901 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPL3LQ92901 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPL3LQ92901 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPL3LQ92901 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RPL3LQ92901 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPL3LQ92901 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPL3LQ92901 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPL3LQ92901 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPL3LQ92901 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPL3LQ92901 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPL3LQ92901 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPL3LQ92901 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPL3LQ92901 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL3LQ92901 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL3LQ92901 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL3LQ92901 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RPL3LQ92901 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RPL3LQ92901 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPL3LQ92901 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
RPL3LQ92901 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPL3LQ92901 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPL3LQ92901 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPL3LQ92901 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RPL3LQ92901 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPL3LQ92901 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPL3LQ92901 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPL3LQ92901 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL3LQ92901 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL3LQ92901 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL3LQ92901 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL3LQ92901 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL3LQ92901 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL3LQ92901 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL3LQ92901 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPL3LQ92901 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPL3LQ92901 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPL3LQ92901 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPL3LQ92901 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPL3LQ92901 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPL3LQ92901 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPL3LQ92901 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPL3LQ92901 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPL3LQ92901 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPL3LQ92901 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPL3LQ92901 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPL3LQ92901 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RPL3LQ92901 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPL3LQ92901 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPL3LQ92901 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPL3LQ92901 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPL3LQ92901 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPL3LQ92901 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPL3LQ92901 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPL3LQ92901 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPL3LQ92901 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPL3LQ92901 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPL3LQ92901 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RPL3LQ92901 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPL3LQ92901 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPL3LQ92901 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPL3LQ92901 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RPL3LQ92901 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPL3LQ92901 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPL3LQ92901 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPL3LQ92901 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPL3LQ92901 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPL3LQ92901 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPL3LQ92901 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPL3LQ92901 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
RPL3LQ92901 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPL3LQ92901 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPL3LQ92901 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPL3LQ92901 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPL3LQ92901 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPL3LQ92901 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPL3LQ92901 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPL3LQ92901 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms