Protein–RNA interactions for Protein: Q92537

SUSD6, Sushi domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD6Q92537 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SUSD6Q92537 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SUSD6Q92537 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SUSD6Q92537 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SUSD6Q92537 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SUSD6Q92537 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SUSD6Q92537 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SUSD6Q92537 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SUSD6Q92537 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SUSD6Q92537 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SUSD6Q92537 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SUSD6Q92537 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SUSD6Q92537 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SUSD6Q92537 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SUSD6Q92537 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SUSD6Q92537 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SUSD6Q92537 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SUSD6Q92537 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SUSD6Q92537 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SUSD6Q92537 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SUSD6Q92537 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SUSD6Q92537 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SUSD6Q92537 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SUSD6Q92537 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SUSD6Q92537 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SUSD6Q92537 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SUSD6Q92537 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SUSD6Q92537 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SUSD6Q92537 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SUSD6Q92537 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SUSD6Q92537 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SUSD6Q92537 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SUSD6Q92537 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SUSD6Q92537 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SUSD6Q92537 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SUSD6Q92537 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SUSD6Q92537 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SUSD6Q92537 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SUSD6Q92537 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SUSD6Q92537 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SUSD6Q92537 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SUSD6Q92537 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SUSD6Q92537 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SUSD6Q92537 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SUSD6Q92537 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SUSD6Q92537 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SUSD6Q92537 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SUSD6Q92537 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SUSD6Q92537 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SUSD6Q92537 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SUSD6Q92537 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SUSD6Q92537 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SUSD6Q92537 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SUSD6Q92537 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SUSD6Q92537 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SUSD6Q92537 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SUSD6Q92537 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SUSD6Q92537 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SUSD6Q92537 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SUSD6Q92537 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SUSD6Q92537 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SUSD6Q92537 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SUSD6Q92537 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SUSD6Q92537 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SUSD6Q92537 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SUSD6Q92537 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SUSD6Q92537 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SUSD6Q92537 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SUSD6Q92537 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SUSD6Q92537 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SUSD6Q92537 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SUSD6Q92537 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SUSD6Q92537 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SUSD6Q92537 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SUSD6Q92537 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SUSD6Q92537 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SUSD6Q92537 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SUSD6Q92537 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SUSD6Q92537 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SUSD6Q92537 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SUSD6Q92537 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SUSD6Q92537 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SUSD6Q92537 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SUSD6Q92537 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SUSD6Q92537 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SUSD6Q92537 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SUSD6Q92537 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SUSD6Q92537 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SUSD6Q92537 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SUSD6Q92537 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SUSD6Q92537 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SUSD6Q92537 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SUSD6Q92537 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SUSD6Q92537 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SUSD6Q92537 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SUSD6Q92537 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SUSD6Q92537 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SUSD6Q92537 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SUSD6Q92537 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SUSD6Q92537 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms