Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD9

CASKIN1, Caskin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKIN1Q8WXD9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
CASKIN1Q8WXD9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.67■■■■■ 4.1
CASKIN1Q8WXD9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
CASKIN1Q8WXD9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC40.66■■■■■ 4.1
CASKIN1Q8WXD9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
CASKIN1Q8WXD9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
CASKIN1Q8WXD9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC40.65■■■■■ 4.1
CASKIN1Q8WXD9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
CASKIN1Q8WXD9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
CASKIN1Q8WXD9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
CASKIN1Q8WXD9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC40.63■■■■■ 4.09
CASKIN1Q8WXD9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC40.62■■■■■ 4.09
CASKIN1Q8WXD9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.61■■■■■ 4.09
CASKIN1Q8WXD9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
CASKIN1Q8WXD9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC40.61■■■■■ 4.09
CASKIN1Q8WXD9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
CASKIN1Q8WXD9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC40.6■■■■■ 4.09
CASKIN1Q8WXD9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC40.6■■■■■ 4.09
CASKIN1Q8WXD9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
CASKIN1Q8WXD9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC40.58■■■■■ 4.09
CASKIN1Q8WXD9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC40.58■■■■■ 4.09
CASKIN1Q8WXD9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.57■■■■■ 4.08
CASKIN1Q8WXD9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
CASKIN1Q8WXD9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.56■■■■■ 4.08
CASKIN1Q8WXD9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC40.55■■■■■ 4.08
CASKIN1Q8WXD9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC40.55■■■■■ 4.08
CASKIN1Q8WXD9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
CASKIN1Q8WXD9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
CASKIN1Q8WXD9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
CASKIN1Q8WXD9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC40.53■■■■■ 4.08
CASKIN1Q8WXD9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC40.52■■■■■ 4.08
CASKIN1Q8WXD9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
CASKIN1Q8WXD9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
CASKIN1Q8WXD9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
CASKIN1Q8WXD9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC40.52■■■■■ 4.08
CASKIN1Q8WXD9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.52■■■■■ 4.08
CASKIN1Q8WXD9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
CASKIN1Q8WXD9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.51■■■■■ 4.08
CASKIN1Q8WXD9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.51■■■■■ 4.08
CASKIN1Q8WXD9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC40.51■■■■■ 4.08
CASKIN1Q8WXD9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.51■■■■■ 4.08
CASKIN1Q8WXD9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
CASKIN1Q8WXD9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
CASKIN1Q8WXD9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
CASKIN1Q8WXD9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC40.5■■■■■ 4.07
CASKIN1Q8WXD9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC40.5■■■■■ 4.07
CASKIN1Q8WXD9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC40.5■■■■■ 4.07
CASKIN1Q8WXD9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC40.5■■■■■ 4.07
CASKIN1Q8WXD9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
CASKIN1Q8WXD9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
CASKIN1Q8WXD9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
CASKIN1Q8WXD9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
CASKIN1Q8WXD9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC40.47■■■■■ 4.07
CASKIN1Q8WXD9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
CASKIN1Q8WXD9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC40.47■■■■■ 4.07
CASKIN1Q8WXD9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC40.47■■■■■ 4.07
CASKIN1Q8WXD9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
CASKIN1Q8WXD9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
CASKIN1Q8WXD9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC40.46■■■■■ 4.07
CASKIN1Q8WXD9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
CASKIN1Q8WXD9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
CASKIN1Q8WXD9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
CASKIN1Q8WXD9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.45■■■■■ 4.07
CASKIN1Q8WXD9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC40.45■■■■■ 4.07
CASKIN1Q8WXD9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC40.44■■■■■ 4.06
CASKIN1Q8WXD9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC40.44■■■■■ 4.06
CASKIN1Q8WXD9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC40.44■■■■■ 4.06
CASKIN1Q8WXD9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC40.44■■■■■ 4.06
CASKIN1Q8WXD9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
CASKIN1Q8WXD9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
CASKIN1Q8WXD9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
CASKIN1Q8WXD9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC40.43■■■■■ 4.06
CASKIN1Q8WXD9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
CASKIN1Q8WXD9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.42■■■■■ 4.06
CASKIN1Q8WXD9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC40.42■■■■■ 4.06
CASKIN1Q8WXD9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC40.41■■■■■ 4.06
CASKIN1Q8WXD9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
CASKIN1Q8WXD9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC40.41■■■■■ 4.06
CASKIN1Q8WXD9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
CASKIN1Q8WXD9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
CASKIN1Q8WXD9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.4■■■■■ 4.06
CASKIN1Q8WXD9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC40.4■■■■■ 4.06
CASKIN1Q8WXD9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC40.4■■■■■ 4.06
CASKIN1Q8WXD9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.39■■■■■ 4.06
CASKIN1Q8WXD9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
CASKIN1Q8WXD9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.38■■■■■ 4.05
CASKIN1Q8WXD9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
CASKIN1Q8WXD9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
CASKIN1Q8WXD9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
CASKIN1Q8WXD9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC40.36■■■■■ 4.05
CASKIN1Q8WXD9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
CASKIN1Q8WXD9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
CASKIN1Q8WXD9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.35■■■■■ 4.05
CASKIN1Q8WXD9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
CASKIN1Q8WXD9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
CASKIN1Q8WXD9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
CASKIN1Q8WXD9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC40.33■■■■■ 4.05
CASKIN1Q8WXD9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC40.33■■■■■ 4.05
CASKIN1Q8WXD9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
CASKIN1Q8WXD9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms