Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW22

DNAJA4, DnaJ homolog subfamily A member 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA4Q8WW22 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAJA4Q8WW22 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAJA4Q8WW22 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAJA4Q8WW22 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAJA4Q8WW22 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNAJA4Q8WW22 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNAJA4Q8WW22 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNAJA4Q8WW22 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNAJA4Q8WW22 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNAJA4Q8WW22 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNAJA4Q8WW22 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAJA4Q8WW22 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAJA4Q8WW22 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAJA4Q8WW22 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAJA4Q8WW22 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAJA4Q8WW22 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAJA4Q8WW22 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNAJA4Q8WW22 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNAJA4Q8WW22 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNAJA4Q8WW22 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNAJA4Q8WW22 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNAJA4Q8WW22 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNAJA4Q8WW22 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNAJA4Q8WW22 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNAJA4Q8WW22 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNAJA4Q8WW22 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNAJA4Q8WW22 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNAJA4Q8WW22 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNAJA4Q8WW22 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNAJA4Q8WW22 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNAJA4Q8WW22 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNAJA4Q8WW22 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNAJA4Q8WW22 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DNAJA4Q8WW22 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DNAJA4Q8WW22 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DNAJA4Q8WW22 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DNAJA4Q8WW22 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DNAJA4Q8WW22 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DNAJA4Q8WW22 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNAJA4Q8WW22 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNAJA4Q8WW22 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNAJA4Q8WW22 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNAJA4Q8WW22 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNAJA4Q8WW22 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
DNAJA4Q8WW22 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNAJA4Q8WW22 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNAJA4Q8WW22 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNAJA4Q8WW22 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNAJA4Q8WW22 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNAJA4Q8WW22 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNAJA4Q8WW22 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNAJA4Q8WW22 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNAJA4Q8WW22 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNAJA4Q8WW22 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNAJA4Q8WW22 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DNAJA4Q8WW22 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DNAJA4Q8WW22 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DNAJA4Q8WW22 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DNAJA4Q8WW22 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DNAJA4Q8WW22 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DNAJA4Q8WW22 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
DNAJA4Q8WW22 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DNAJA4Q8WW22 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DNAJA4Q8WW22 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DNAJA4Q8WW22 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
DNAJA4Q8WW22 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNAJA4Q8WW22 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
DNAJA4Q8WW22 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNAJA4Q8WW22 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNAJA4Q8WW22 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNAJA4Q8WW22 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNAJA4Q8WW22 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNAJA4Q8WW22 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNAJA4Q8WW22 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNAJA4Q8WW22 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNAJA4Q8WW22 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNAJA4Q8WW22 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAJA4Q8WW22 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAJA4Q8WW22 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAJA4Q8WW22 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAJA4Q8WW22 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAJA4Q8WW22 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAJA4Q8WW22 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAJA4Q8WW22 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAJA4Q8WW22 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAJA4Q8WW22 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAJA4Q8WW22 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAJA4Q8WW22 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAJA4Q8WW22 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAJA4Q8WW22 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAJA4Q8WW22 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAJA4Q8WW22 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAJA4Q8WW22 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAJA4Q8WW22 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAJA4Q8WW22 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAJA4Q8WW22 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAJA4Q8WW22 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAJA4Q8WW22 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAJA4Q8WW22 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAJA4Q8WW22 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms