Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV35

LRRC29, Leucine-rich repeat-containing protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC29Q8WV35 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC29Q8WV35 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC29Q8WV35 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC29Q8WV35 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC29Q8WV35 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC29Q8WV35 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC29Q8WV35 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC29Q8WV35 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC29Q8WV35 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC29Q8WV35 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC29Q8WV35 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC29Q8WV35 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC29Q8WV35 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC29Q8WV35 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC29Q8WV35 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC29Q8WV35 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC29Q8WV35 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC29Q8WV35 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC29Q8WV35 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC29Q8WV35 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC29Q8WV35 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC29Q8WV35 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC29Q8WV35 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC29Q8WV35 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC29Q8WV35 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC29Q8WV35 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC29Q8WV35 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC29Q8WV35 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC29Q8WV35 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC29Q8WV35 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC29Q8WV35 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC29Q8WV35 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC29Q8WV35 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC29Q8WV35 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC29Q8WV35 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC29Q8WV35 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC29Q8WV35 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC29Q8WV35 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC29Q8WV35 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC29Q8WV35 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LRRC29Q8WV35 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC29Q8WV35 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC29Q8WV35 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC29Q8WV35 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC29Q8WV35 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC29Q8WV35 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC29Q8WV35 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC29Q8WV35 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC29Q8WV35 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC29Q8WV35 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC29Q8WV35 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC29Q8WV35 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC29Q8WV35 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC29Q8WV35 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC29Q8WV35 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC29Q8WV35 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC29Q8WV35 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC29Q8WV35 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC29Q8WV35 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC29Q8WV35 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC29Q8WV35 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC29Q8WV35 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC29Q8WV35 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC29Q8WV35 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC29Q8WV35 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC29Q8WV35 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC29Q8WV35 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC29Q8WV35 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC29Q8WV35 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC29Q8WV35 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC29Q8WV35 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC29Q8WV35 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRC29Q8WV35 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC29Q8WV35 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC29Q8WV35 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC29Q8WV35 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC29Q8WV35 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC29Q8WV35 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC29Q8WV35 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC29Q8WV35 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC29Q8WV35 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC29Q8WV35 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC29Q8WV35 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC29Q8WV35 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC29Q8WV35 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC29Q8WV35 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC29Q8WV35 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC29Q8WV35 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC29Q8WV35 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC29Q8WV35 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC29Q8WV35 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC29Q8WV35 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC29Q8WV35 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC29Q8WV35 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC29Q8WV35 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC29Q8WV35 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC29Q8WV35 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC29Q8WV35 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC29Q8WV35 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC29Q8WV35 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms