Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP9

ZNF555, Zinc finger protein 555, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF555Q8NEP9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF555Q8NEP9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF555Q8NEP9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF555Q8NEP9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF555Q8NEP9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF555Q8NEP9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF555Q8NEP9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF555Q8NEP9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF555Q8NEP9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF555Q8NEP9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF555Q8NEP9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF555Q8NEP9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF555Q8NEP9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF555Q8NEP9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF555Q8NEP9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF555Q8NEP9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF555Q8NEP9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF555Q8NEP9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF555Q8NEP9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF555Q8NEP9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF555Q8NEP9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF555Q8NEP9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF555Q8NEP9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF555Q8NEP9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF555Q8NEP9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF555Q8NEP9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF555Q8NEP9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF555Q8NEP9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF555Q8NEP9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF555Q8NEP9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF555Q8NEP9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF555Q8NEP9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF555Q8NEP9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF555Q8NEP9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF555Q8NEP9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF555Q8NEP9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF555Q8NEP9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF555Q8NEP9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF555Q8NEP9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF555Q8NEP9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF555Q8NEP9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF555Q8NEP9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF555Q8NEP9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF555Q8NEP9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZNF555Q8NEP9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF555Q8NEP9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF555Q8NEP9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF555Q8NEP9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF555Q8NEP9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF555Q8NEP9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF555Q8NEP9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF555Q8NEP9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF555Q8NEP9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF555Q8NEP9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF555Q8NEP9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF555Q8NEP9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF555Q8NEP9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF555Q8NEP9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF555Q8NEP9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF555Q8NEP9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF555Q8NEP9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF555Q8NEP9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF555Q8NEP9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF555Q8NEP9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF555Q8NEP9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF555Q8NEP9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF555Q8NEP9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF555Q8NEP9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF555Q8NEP9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF555Q8NEP9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF555Q8NEP9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF555Q8NEP9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF555Q8NEP9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF555Q8NEP9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF555Q8NEP9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF555Q8NEP9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF555Q8NEP9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF555Q8NEP9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF555Q8NEP9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF555Q8NEP9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF555Q8NEP9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF555Q8NEP9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF555Q8NEP9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF555Q8NEP9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF555Q8NEP9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF555Q8NEP9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF555Q8NEP9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF555Q8NEP9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF555Q8NEP9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF555Q8NEP9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF555Q8NEP9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZNF555Q8NEP9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZNF555Q8NEP9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF555Q8NEP9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF555Q8NEP9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF555Q8NEP9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF555Q8NEP9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF555Q8NEP9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF555Q8NEP9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF555Q8NEP9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms