Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDH2

CCDC168, Coiled-coil domain-containing protein 168, humanhuman

Predictions only

Length 2,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC168Q8NDH2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC168Q8NDH2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC168Q8NDH2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC168Q8NDH2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC168Q8NDH2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC168Q8NDH2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC168Q8NDH2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC168Q8NDH2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC168Q8NDH2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC168Q8NDH2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC168Q8NDH2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC168Q8NDH2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC168Q8NDH2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC168Q8NDH2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC168Q8NDH2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC168Q8NDH2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC168Q8NDH2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC168Q8NDH2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC168Q8NDH2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC168Q8NDH2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC168Q8NDH2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC168Q8NDH2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC168Q8NDH2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC168Q8NDH2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC168Q8NDH2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC168Q8NDH2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC168Q8NDH2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC168Q8NDH2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC168Q8NDH2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC168Q8NDH2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC168Q8NDH2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC168Q8NDH2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC168Q8NDH2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC168Q8NDH2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC168Q8NDH2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC168Q8NDH2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC168Q8NDH2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC168Q8NDH2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC168Q8NDH2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC168Q8NDH2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC168Q8NDH2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC168Q8NDH2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC168Q8NDH2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC168Q8NDH2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC168Q8NDH2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC168Q8NDH2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC168Q8NDH2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC168Q8NDH2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC168Q8NDH2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC168Q8NDH2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC168Q8NDH2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC168Q8NDH2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC168Q8NDH2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC168Q8NDH2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC168Q8NDH2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC168Q8NDH2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC168Q8NDH2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC168Q8NDH2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC168Q8NDH2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC168Q8NDH2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC168Q8NDH2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC168Q8NDH2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC168Q8NDH2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC168Q8NDH2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC168Q8NDH2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC168Q8NDH2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC168Q8NDH2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC168Q8NDH2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC168Q8NDH2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC168Q8NDH2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC168Q8NDH2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC168Q8NDH2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC168Q8NDH2 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC168Q8NDH2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC168Q8NDH2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC168Q8NDH2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC168Q8NDH2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC168Q8NDH2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC168Q8NDH2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC168Q8NDH2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC168Q8NDH2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC168Q8NDH2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC168Q8NDH2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC168Q8NDH2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC168Q8NDH2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC168Q8NDH2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC168Q8NDH2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC168Q8NDH2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC168Q8NDH2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC168Q8NDH2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC168Q8NDH2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC168Q8NDH2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC168Q8NDH2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC168Q8NDH2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC168Q8NDH2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC168Q8NDH2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC168Q8NDH2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC168Q8NDH2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC168Q8NDH2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC168Q8NDH2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.3 ms