Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9F7

GDPD1, Lysophospholipase D GDPD1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD1Q8N9F7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDPD1Q8N9F7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDPD1Q8N9F7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDPD1Q8N9F7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GDPD1Q8N9F7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GDPD1Q8N9F7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDPD1Q8N9F7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDPD1Q8N9F7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GDPD1Q8N9F7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDPD1Q8N9F7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDPD1Q8N9F7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDPD1Q8N9F7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GDPD1Q8N9F7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GDPD1Q8N9F7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GDPD1Q8N9F7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GDPD1Q8N9F7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GDPD1Q8N9F7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GDPD1Q8N9F7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GDPD1Q8N9F7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GDPD1Q8N9F7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GDPD1Q8N9F7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GDPD1Q8N9F7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GDPD1Q8N9F7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GDPD1Q8N9F7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GDPD1Q8N9F7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GDPD1Q8N9F7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GDPD1Q8N9F7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GDPD1Q8N9F7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GDPD1Q8N9F7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GDPD1Q8N9F7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GDPD1Q8N9F7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GDPD1Q8N9F7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GDPD1Q8N9F7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GDPD1Q8N9F7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GDPD1Q8N9F7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GDPD1Q8N9F7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GDPD1Q8N9F7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GDPD1Q8N9F7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GDPD1Q8N9F7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GDPD1Q8N9F7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GDPD1Q8N9F7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GDPD1Q8N9F7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GDPD1Q8N9F7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GDPD1Q8N9F7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GDPD1Q8N9F7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GDPD1Q8N9F7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GDPD1Q8N9F7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GDPD1Q8N9F7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GDPD1Q8N9F7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GDPD1Q8N9F7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GDPD1Q8N9F7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GDPD1Q8N9F7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GDPD1Q8N9F7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GDPD1Q8N9F7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GDPD1Q8N9F7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GDPD1Q8N9F7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GDPD1Q8N9F7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GDPD1Q8N9F7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDPD1Q8N9F7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDPD1Q8N9F7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDPD1Q8N9F7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GDPD1Q8N9F7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GDPD1Q8N9F7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDPD1Q8N9F7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDPD1Q8N9F7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDPD1Q8N9F7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDPD1Q8N9F7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDPD1Q8N9F7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDPD1Q8N9F7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDPD1Q8N9F7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDPD1Q8N9F7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDPD1Q8N9F7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDPD1Q8N9F7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDPD1Q8N9F7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDPD1Q8N9F7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDPD1Q8N9F7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDPD1Q8N9F7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDPD1Q8N9F7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDPD1Q8N9F7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDPD1Q8N9F7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDPD1Q8N9F7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDPD1Q8N9F7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDPD1Q8N9F7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDPD1Q8N9F7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDPD1Q8N9F7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDPD1Q8N9F7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDPD1Q8N9F7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDPD1Q8N9F7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GDPD1Q8N9F7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDPD1Q8N9F7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GDPD1Q8N9F7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GDPD1Q8N9F7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GDPD1Q8N9F7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDPD1Q8N9F7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDPD1Q8N9F7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDPD1Q8N9F7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDPD1Q8N9F7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDPD1Q8N9F7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDPD1Q8N9F7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDPD1Q8N9F7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms