Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SVBPQ8N300 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SVBPQ8N300 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SVBPQ8N300 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SVBPQ8N300 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SVBPQ8N300 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SVBPQ8N300 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SVBPQ8N300 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SVBPQ8N300 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SVBPQ8N300 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SVBPQ8N300 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SVBPQ8N300 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SVBPQ8N300 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SVBPQ8N300 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SVBPQ8N300 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SVBPQ8N300 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SVBPQ8N300 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SVBPQ8N300 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SVBPQ8N300 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SVBPQ8N300 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SVBPQ8N300 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SVBPQ8N300 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SVBPQ8N300 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SVBPQ8N300 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SVBPQ8N300 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SVBPQ8N300 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SVBPQ8N300 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SVBPQ8N300 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SVBPQ8N300 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SVBPQ8N300 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SVBPQ8N300 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SVBPQ8N300 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SVBPQ8N300 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SVBPQ8N300 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SVBPQ8N300 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SVBPQ8N300 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SVBPQ8N300 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SVBPQ8N300 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SVBPQ8N300 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SVBPQ8N300 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SVBPQ8N300 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SVBPQ8N300 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SVBPQ8N300 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SVBPQ8N300 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SVBPQ8N300 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SVBPQ8N300 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SVBPQ8N300 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SVBPQ8N300 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SVBPQ8N300 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SVBPQ8N300 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SVBPQ8N300 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SVBPQ8N300 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SVBPQ8N300 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SVBPQ8N300 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SVBPQ8N300 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SVBPQ8N300 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SVBPQ8N300 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SVBPQ8N300 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SVBPQ8N300 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SVBPQ8N300 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SVBPQ8N300 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SVBPQ8N300 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SVBPQ8N300 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SVBPQ8N300 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SVBPQ8N300 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SVBPQ8N300 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SVBPQ8N300 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SVBPQ8N300 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SVBPQ8N300 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SVBPQ8N300 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SVBPQ8N300 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SVBPQ8N300 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SVBPQ8N300 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SVBPQ8N300 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SVBPQ8N300 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SVBPQ8N300 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SVBPQ8N300 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SVBPQ8N300 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SVBPQ8N300 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SVBPQ8N300 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SVBPQ8N300 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SVBPQ8N300 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SVBPQ8N300 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SVBPQ8N300 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SVBPQ8N300 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SVBPQ8N300 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SVBPQ8N300 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SVBPQ8N300 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SVBPQ8N300 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SVBPQ8N300 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SVBPQ8N300 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SVBPQ8N300 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SVBPQ8N300 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SVBPQ8N300 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SVBPQ8N300 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SVBPQ8N300 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SVBPQ8N300 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SVBPQ8N300 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SVBPQ8N300 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SVBPQ8N300 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms