Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYX3

CCDC116, Coiled-coil domain-containing protein 116, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC116Q8IYX3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC116Q8IYX3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC116Q8IYX3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC116Q8IYX3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC116Q8IYX3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC116Q8IYX3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC116Q8IYX3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC116Q8IYX3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC116Q8IYX3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC116Q8IYX3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC116Q8IYX3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC116Q8IYX3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC116Q8IYX3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC116Q8IYX3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC116Q8IYX3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC116Q8IYX3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC116Q8IYX3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC116Q8IYX3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC116Q8IYX3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC116Q8IYX3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC116Q8IYX3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC116Q8IYX3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC116Q8IYX3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC116Q8IYX3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC116Q8IYX3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC116Q8IYX3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC116Q8IYX3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC116Q8IYX3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC116Q8IYX3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC116Q8IYX3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC116Q8IYX3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC116Q8IYX3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC116Q8IYX3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC116Q8IYX3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC116Q8IYX3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC116Q8IYX3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC116Q8IYX3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC116Q8IYX3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC116Q8IYX3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC116Q8IYX3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC116Q8IYX3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC116Q8IYX3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC116Q8IYX3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC116Q8IYX3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC116Q8IYX3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC116Q8IYX3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC116Q8IYX3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC116Q8IYX3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC116Q8IYX3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC116Q8IYX3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC116Q8IYX3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC116Q8IYX3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC116Q8IYX3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC116Q8IYX3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC116Q8IYX3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC116Q8IYX3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC116Q8IYX3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC116Q8IYX3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC116Q8IYX3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC116Q8IYX3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC116Q8IYX3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC116Q8IYX3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC116Q8IYX3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC116Q8IYX3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC116Q8IYX3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC116Q8IYX3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC116Q8IYX3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC116Q8IYX3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC116Q8IYX3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC116Q8IYX3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC116Q8IYX3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
CCDC116Q8IYX3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC116Q8IYX3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC116Q8IYX3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC116Q8IYX3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC116Q8IYX3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC116Q8IYX3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC116Q8IYX3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CCDC116Q8IYX3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC116Q8IYX3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC116Q8IYX3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC116Q8IYX3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC116Q8IYX3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC116Q8IYX3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC116Q8IYX3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC116Q8IYX3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC116Q8IYX3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC116Q8IYX3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC116Q8IYX3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC116Q8IYX3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC116Q8IYX3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC116Q8IYX3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC116Q8IYX3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC116Q8IYX3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC116Q8IYX3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC116Q8IYX3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC116Q8IYX3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC116Q8IYX3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC116Q8IYX3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC116Q8IYX3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms