Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYD8

FANCM, Fanconi anemia group M protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,048 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCMQ8IYD8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FANCMQ8IYD8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FANCMQ8IYD8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FANCMQ8IYD8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FANCMQ8IYD8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FANCMQ8IYD8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FANCMQ8IYD8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FANCMQ8IYD8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FANCMQ8IYD8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FANCMQ8IYD8 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FANCMQ8IYD8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FANCMQ8IYD8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FANCMQ8IYD8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FANCMQ8IYD8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FANCMQ8IYD8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
FANCMQ8IYD8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
FANCMQ8IYD8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FANCMQ8IYD8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FANCMQ8IYD8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FANCMQ8IYD8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FANCMQ8IYD8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FANCMQ8IYD8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
FANCMQ8IYD8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FANCMQ8IYD8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FANCMQ8IYD8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FANCMQ8IYD8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
FANCMQ8IYD8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
FANCMQ8IYD8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FANCMQ8IYD8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FANCMQ8IYD8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FANCMQ8IYD8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FANCMQ8IYD8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FANCMQ8IYD8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FANCMQ8IYD8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FANCMQ8IYD8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FANCMQ8IYD8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FANCMQ8IYD8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26■■□□□ 1.75
FANCMQ8IYD8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FANCMQ8IYD8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FANCMQ8IYD8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FANCMQ8IYD8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FANCMQ8IYD8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FANCMQ8IYD8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FANCMQ8IYD8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FANCMQ8IYD8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FANCMQ8IYD8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FANCMQ8IYD8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FANCMQ8IYD8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
FANCMQ8IYD8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FANCMQ8IYD8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
FANCMQ8IYD8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FANCMQ8IYD8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FANCMQ8IYD8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
FANCMQ8IYD8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
FANCMQ8IYD8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
FANCMQ8IYD8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
FANCMQ8IYD8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FANCMQ8IYD8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FANCMQ8IYD8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FANCMQ8IYD8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FANCMQ8IYD8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FANCMQ8IYD8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FANCMQ8IYD8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FANCMQ8IYD8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FANCMQ8IYD8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FANCMQ8IYD8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FANCMQ8IYD8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FANCMQ8IYD8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FANCMQ8IYD8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FANCMQ8IYD8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FANCMQ8IYD8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FANCMQ8IYD8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FANCMQ8IYD8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FANCMQ8IYD8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FANCMQ8IYD8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FANCMQ8IYD8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FANCMQ8IYD8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FANCMQ8IYD8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FANCMQ8IYD8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
FANCMQ8IYD8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
FANCMQ8IYD8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FANCMQ8IYD8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FANCMQ8IYD8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
FANCMQ8IYD8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FANCMQ8IYD8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FANCMQ8IYD8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FANCMQ8IYD8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FANCMQ8IYD8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FANCMQ8IYD8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FANCMQ8IYD8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FANCMQ8IYD8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FANCMQ8IYD8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FANCMQ8IYD8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FANCMQ8IYD8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FANCMQ8IYD8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FANCMQ8IYD8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FANCMQ8IYD8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FANCMQ8IYD8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FANCMQ8IYD8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FANCMQ8IYD8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms