Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW00

VSTM4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4Q8IW00 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VSTM4Q8IW00 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VSTM4Q8IW00 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VSTM4Q8IW00 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VSTM4Q8IW00 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VSTM4Q8IW00 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VSTM4Q8IW00 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VSTM4Q8IW00 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VSTM4Q8IW00 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VSTM4Q8IW00 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VSTM4Q8IW00 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VSTM4Q8IW00 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VSTM4Q8IW00 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
VSTM4Q8IW00 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
VSTM4Q8IW00 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
VSTM4Q8IW00 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
VSTM4Q8IW00 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
VSTM4Q8IW00 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VSTM4Q8IW00 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VSTM4Q8IW00 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
VSTM4Q8IW00 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
VSTM4Q8IW00 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
VSTM4Q8IW00 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
VSTM4Q8IW00 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
VSTM4Q8IW00 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
VSTM4Q8IW00 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
VSTM4Q8IW00 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
VSTM4Q8IW00 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
VSTM4Q8IW00 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
VSTM4Q8IW00 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
VSTM4Q8IW00 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
VSTM4Q8IW00 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
VSTM4Q8IW00 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VSTM4Q8IW00 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VSTM4Q8IW00 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
VSTM4Q8IW00 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VSTM4Q8IW00 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
VSTM4Q8IW00 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VSTM4Q8IW00 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
VSTM4Q8IW00 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VSTM4Q8IW00 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VSTM4Q8IW00 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
VSTM4Q8IW00 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
VSTM4Q8IW00 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VSTM4Q8IW00 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
VSTM4Q8IW00 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
VSTM4Q8IW00 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28■■■□□ 2.07
VSTM4Q8IW00 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
VSTM4Q8IW00 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VSTM4Q8IW00 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VSTM4Q8IW00 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VSTM4Q8IW00 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
VSTM4Q8IW00 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VSTM4Q8IW00 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
VSTM4Q8IW00 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
VSTM4Q8IW00 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
VSTM4Q8IW00 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
VSTM4Q8IW00 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VSTM4Q8IW00 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VSTM4Q8IW00 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VSTM4Q8IW00 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
VSTM4Q8IW00 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
VSTM4Q8IW00 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
VSTM4Q8IW00 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
VSTM4Q8IW00 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
VSTM4Q8IW00 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
VSTM4Q8IW00 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
VSTM4Q8IW00 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
VSTM4Q8IW00 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VSTM4Q8IW00 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VSTM4Q8IW00 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
VSTM4Q8IW00 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
VSTM4Q8IW00 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VSTM4Q8IW00 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VSTM4Q8IW00 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
VSTM4Q8IW00 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
VSTM4Q8IW00 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
VSTM4Q8IW00 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
VSTM4Q8IW00 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
VSTM4Q8IW00 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
VSTM4Q8IW00 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
VSTM4Q8IW00 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
VSTM4Q8IW00 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
VSTM4Q8IW00 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
VSTM4Q8IW00 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
VSTM4Q8IW00 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
VSTM4Q8IW00 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
VSTM4Q8IW00 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
VSTM4Q8IW00 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
VSTM4Q8IW00 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
VSTM4Q8IW00 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
VSTM4Q8IW00 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
VSTM4Q8IW00 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
VSTM4Q8IW00 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
VSTM4Q8IW00 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
VSTM4Q8IW00 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
VSTM4Q8IW00 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
VSTM4Q8IW00 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
VSTM4Q8IW00 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
VSTM4Q8IW00 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms