Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV50

LYSMD2, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSMD2Q8IV50 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LYSMD2Q8IV50 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LYSMD2Q8IV50 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LYSMD2Q8IV50 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LYSMD2Q8IV50 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LYSMD2Q8IV50 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LYSMD2Q8IV50 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LYSMD2Q8IV50 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LYSMD2Q8IV50 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LYSMD2Q8IV50 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LYSMD2Q8IV50 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LYSMD2Q8IV50 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LYSMD2Q8IV50 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LYSMD2Q8IV50 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LYSMD2Q8IV50 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LYSMD2Q8IV50 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LYSMD2Q8IV50 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LYSMD2Q8IV50 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LYSMD2Q8IV50 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LYSMD2Q8IV50 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LYSMD2Q8IV50 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LYSMD2Q8IV50 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LYSMD2Q8IV50 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LYSMD2Q8IV50 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LYSMD2Q8IV50 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LYSMD2Q8IV50 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LYSMD2Q8IV50 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LYSMD2Q8IV50 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LYSMD2Q8IV50 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LYSMD2Q8IV50 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LYSMD2Q8IV50 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LYSMD2Q8IV50 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LYSMD2Q8IV50 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LYSMD2Q8IV50 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LYSMD2Q8IV50 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LYSMD2Q8IV50 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LYSMD2Q8IV50 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LYSMD2Q8IV50 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LYSMD2Q8IV50 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LYSMD2Q8IV50 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LYSMD2Q8IV50 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LYSMD2Q8IV50 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LYSMD2Q8IV50 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LYSMD2Q8IV50 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LYSMD2Q8IV50 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LYSMD2Q8IV50 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LYSMD2Q8IV50 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LYSMD2Q8IV50 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LYSMD2Q8IV50 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LYSMD2Q8IV50 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LYSMD2Q8IV50 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LYSMD2Q8IV50 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LYSMD2Q8IV50 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LYSMD2Q8IV50 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LYSMD2Q8IV50 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LYSMD2Q8IV50 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LYSMD2Q8IV50 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LYSMD2Q8IV50 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LYSMD2Q8IV50 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LYSMD2Q8IV50 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LYSMD2Q8IV50 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LYSMD2Q8IV50 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LYSMD2Q8IV50 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LYSMD2Q8IV50 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LYSMD2Q8IV50 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LYSMD2Q8IV50 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LYSMD2Q8IV50 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LYSMD2Q8IV50 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LYSMD2Q8IV50 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LYSMD2Q8IV50 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LYSMD2Q8IV50 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LYSMD2Q8IV50 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LYSMD2Q8IV50 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LYSMD2Q8IV50 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LYSMD2Q8IV50 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LYSMD2Q8IV50 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LYSMD2Q8IV50 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LYSMD2Q8IV50 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LYSMD2Q8IV50 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LYSMD2Q8IV50 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LYSMD2Q8IV50 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LYSMD2Q8IV50 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LYSMD2Q8IV50 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LYSMD2Q8IV50 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LYSMD2Q8IV50 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LYSMD2Q8IV50 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LYSMD2Q8IV50 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LYSMD2Q8IV50 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LYSMD2Q8IV50 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LYSMD2Q8IV50 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LYSMD2Q8IV50 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LYSMD2Q8IV50 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LYSMD2Q8IV50 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LYSMD2Q8IV50 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LYSMD2Q8IV50 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LYSMD2Q8IV50 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LYSMD2Q8IV50 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LYSMD2Q8IV50 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LYSMD2Q8IV50 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LYSMD2Q8IV50 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms