Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV48

ERI1, 3'-5' exoribonuclease 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERI1Q8IV48 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERI1Q8IV48 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ERI1Q8IV48 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ERI1Q8IV48 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERI1Q8IV48 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERI1Q8IV48 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERI1Q8IV48 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERI1Q8IV48 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERI1Q8IV48 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERI1Q8IV48 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERI1Q8IV48 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERI1Q8IV48 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERI1Q8IV48 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERI1Q8IV48 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERI1Q8IV48 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERI1Q8IV48 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERI1Q8IV48 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERI1Q8IV48 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ERI1Q8IV48 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERI1Q8IV48 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ERI1Q8IV48 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ERI1Q8IV48 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ERI1Q8IV48 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERI1Q8IV48 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERI1Q8IV48 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERI1Q8IV48 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERI1Q8IV48 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERI1Q8IV48 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERI1Q8IV48 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERI1Q8IV48 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERI1Q8IV48 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ERI1Q8IV48 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERI1Q8IV48 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERI1Q8IV48 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERI1Q8IV48 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERI1Q8IV48 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERI1Q8IV48 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERI1Q8IV48 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERI1Q8IV48 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ERI1Q8IV48 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERI1Q8IV48 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERI1Q8IV48 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERI1Q8IV48 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERI1Q8IV48 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERI1Q8IV48 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERI1Q8IV48 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERI1Q8IV48 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERI1Q8IV48 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERI1Q8IV48 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERI1Q8IV48 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERI1Q8IV48 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERI1Q8IV48 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERI1Q8IV48 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERI1Q8IV48 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERI1Q8IV48 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERI1Q8IV48 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ERI1Q8IV48 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERI1Q8IV48 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERI1Q8IV48 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERI1Q8IV48 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERI1Q8IV48 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERI1Q8IV48 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERI1Q8IV48 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERI1Q8IV48 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERI1Q8IV48 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERI1Q8IV48 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERI1Q8IV48 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERI1Q8IV48 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERI1Q8IV48 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERI1Q8IV48 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERI1Q8IV48 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERI1Q8IV48 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERI1Q8IV48 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERI1Q8IV48 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERI1Q8IV48 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ERI1Q8IV48 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERI1Q8IV48 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERI1Q8IV48 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERI1Q8IV48 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERI1Q8IV48 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERI1Q8IV48 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERI1Q8IV48 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERI1Q8IV48 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERI1Q8IV48 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERI1Q8IV48 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERI1Q8IV48 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERI1Q8IV48 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERI1Q8IV48 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERI1Q8IV48 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERI1Q8IV48 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ERI1Q8IV48 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERI1Q8IV48 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERI1Q8IV48 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERI1Q8IV48 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERI1Q8IV48 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERI1Q8IV48 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERI1Q8IV48 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERI1Q8IV48 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERI1Q8IV48 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERI1Q8IV48 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms