Protein–RNA interactions for Protein: Q86YV9

HPS6, Hermansky-Pudlak syndrome 6 protein, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS6Q86YV9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HPS6Q86YV9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HPS6Q86YV9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HPS6Q86YV9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HPS6Q86YV9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HPS6Q86YV9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HPS6Q86YV9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HPS6Q86YV9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HPS6Q86YV9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HPS6Q86YV9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HPS6Q86YV9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HPS6Q86YV9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HPS6Q86YV9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HPS6Q86YV9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HPS6Q86YV9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HPS6Q86YV9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HPS6Q86YV9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HPS6Q86YV9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HPS6Q86YV9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HPS6Q86YV9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HPS6Q86YV9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HPS6Q86YV9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HPS6Q86YV9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HPS6Q86YV9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HPS6Q86YV9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HPS6Q86YV9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HPS6Q86YV9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HPS6Q86YV9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HPS6Q86YV9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HPS6Q86YV9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HPS6Q86YV9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HPS6Q86YV9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HPS6Q86YV9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HPS6Q86YV9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HPS6Q86YV9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HPS6Q86YV9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HPS6Q86YV9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HPS6Q86YV9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HPS6Q86YV9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HPS6Q86YV9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HPS6Q86YV9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HPS6Q86YV9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HPS6Q86YV9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HPS6Q86YV9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HPS6Q86YV9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HPS6Q86YV9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HPS6Q86YV9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HPS6Q86YV9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
HPS6Q86YV9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HPS6Q86YV9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HPS6Q86YV9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HPS6Q86YV9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HPS6Q86YV9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HPS6Q86YV9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HPS6Q86YV9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HPS6Q86YV9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HPS6Q86YV9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HPS6Q86YV9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HPS6Q86YV9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HPS6Q86YV9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HPS6Q86YV9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HPS6Q86YV9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HPS6Q86YV9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HPS6Q86YV9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HPS6Q86YV9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HPS6Q86YV9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HPS6Q86YV9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HPS6Q86YV9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HPS6Q86YV9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HPS6Q86YV9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HPS6Q86YV9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HPS6Q86YV9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HPS6Q86YV9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HPS6Q86YV9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HPS6Q86YV9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HPS6Q86YV9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HPS6Q86YV9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HPS6Q86YV9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HPS6Q86YV9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HPS6Q86YV9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HPS6Q86YV9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HPS6Q86YV9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HPS6Q86YV9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HPS6Q86YV9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HPS6Q86YV9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HPS6Q86YV9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HPS6Q86YV9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HPS6Q86YV9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HPS6Q86YV9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HPS6Q86YV9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HPS6Q86YV9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HPS6Q86YV9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HPS6Q86YV9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HPS6Q86YV9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HPS6Q86YV9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HPS6Q86YV9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HPS6Q86YV9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HPS6Q86YV9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HPS6Q86YV9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HPS6Q86YV9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms