Protein–RNA interactions for Protein: Q86YC2

PALB2, Partner and localizer of BRCA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALB2Q86YC2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PALB2Q86YC2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PALB2Q86YC2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PALB2Q86YC2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PALB2Q86YC2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PALB2Q86YC2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PALB2Q86YC2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PALB2Q86YC2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PALB2Q86YC2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PALB2Q86YC2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PALB2Q86YC2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PALB2Q86YC2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PALB2Q86YC2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PALB2Q86YC2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PALB2Q86YC2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PALB2Q86YC2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PALB2Q86YC2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PALB2Q86YC2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PALB2Q86YC2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PALB2Q86YC2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PALB2Q86YC2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PALB2Q86YC2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PALB2Q86YC2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PALB2Q86YC2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PALB2Q86YC2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PALB2Q86YC2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PALB2Q86YC2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PALB2Q86YC2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PALB2Q86YC2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PALB2Q86YC2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PALB2Q86YC2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PALB2Q86YC2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PALB2Q86YC2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PALB2Q86YC2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PALB2Q86YC2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PALB2Q86YC2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PALB2Q86YC2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PALB2Q86YC2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PALB2Q86YC2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PALB2Q86YC2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PALB2Q86YC2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PALB2Q86YC2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PALB2Q86YC2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PALB2Q86YC2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PALB2Q86YC2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PALB2Q86YC2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PALB2Q86YC2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PALB2Q86YC2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PALB2Q86YC2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PALB2Q86YC2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PALB2Q86YC2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PALB2Q86YC2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PALB2Q86YC2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PALB2Q86YC2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PALB2Q86YC2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PALB2Q86YC2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PALB2Q86YC2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PALB2Q86YC2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PALB2Q86YC2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PALB2Q86YC2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PALB2Q86YC2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PALB2Q86YC2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PALB2Q86YC2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PALB2Q86YC2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PALB2Q86YC2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PALB2Q86YC2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PALB2Q86YC2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PALB2Q86YC2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PALB2Q86YC2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PALB2Q86YC2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PALB2Q86YC2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PALB2Q86YC2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PALB2Q86YC2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PALB2Q86YC2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PALB2Q86YC2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PALB2Q86YC2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PALB2Q86YC2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PALB2Q86YC2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PALB2Q86YC2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PALB2Q86YC2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PALB2Q86YC2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PALB2Q86YC2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PALB2Q86YC2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PALB2Q86YC2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PALB2Q86YC2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PALB2Q86YC2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PALB2Q86YC2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PALB2Q86YC2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PALB2Q86YC2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PALB2Q86YC2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PALB2Q86YC2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PALB2Q86YC2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PALB2Q86YC2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PALB2Q86YC2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PALB2Q86YC2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PALB2Q86YC2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PALB2Q86YC2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PALB2Q86YC2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PALB2Q86YC2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PALB2Q86YC2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.9 ms