Protein–RNA interactions for Protein: Q86UF4

CCDC190, Coiled-coil domain-containing protein 190, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC190Q86UF4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC190Q86UF4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC190Q86UF4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC190Q86UF4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC190Q86UF4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC190Q86UF4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC190Q86UF4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC190Q86UF4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC190Q86UF4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC190Q86UF4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC190Q86UF4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC190Q86UF4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC190Q86UF4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC190Q86UF4 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC190Q86UF4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC190Q86UF4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC190Q86UF4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC190Q86UF4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC190Q86UF4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC190Q86UF4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC190Q86UF4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC190Q86UF4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC190Q86UF4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC190Q86UF4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC190Q86UF4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC190Q86UF4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC190Q86UF4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC190Q86UF4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC190Q86UF4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC190Q86UF4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC190Q86UF4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC190Q86UF4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC190Q86UF4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC190Q86UF4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC190Q86UF4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC190Q86UF4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC190Q86UF4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC190Q86UF4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC190Q86UF4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC190Q86UF4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC190Q86UF4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC190Q86UF4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC190Q86UF4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC190Q86UF4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC190Q86UF4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC190Q86UF4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC190Q86UF4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC190Q86UF4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC190Q86UF4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC190Q86UF4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC190Q86UF4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC190Q86UF4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC190Q86UF4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC190Q86UF4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC190Q86UF4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC190Q86UF4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC190Q86UF4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC190Q86UF4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC190Q86UF4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC190Q86UF4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC190Q86UF4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC190Q86UF4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC190Q86UF4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC190Q86UF4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC190Q86UF4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC190Q86UF4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC190Q86UF4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC190Q86UF4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC190Q86UF4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC190Q86UF4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC190Q86UF4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC190Q86UF4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC190Q86UF4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC190Q86UF4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC190Q86UF4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC190Q86UF4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC190Q86UF4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC190Q86UF4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC190Q86UF4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC190Q86UF4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC190Q86UF4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC190Q86UF4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC190Q86UF4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC190Q86UF4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC190Q86UF4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC190Q86UF4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC190Q86UF4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC190Q86UF4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC190Q86UF4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC190Q86UF4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC190Q86UF4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC190Q86UF4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC190Q86UF4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC190Q86UF4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC190Q86UF4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC190Q86UF4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC190Q86UF4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC190Q86UF4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC190Q86UF4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC190Q86UF4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms