Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0Q8

RHOU, Rho-related GTP-binding protein RhoU, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOUQ7L0Q8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOUQ7L0Q8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOUQ7L0Q8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOUQ7L0Q8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOUQ7L0Q8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOUQ7L0Q8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOUQ7L0Q8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOUQ7L0Q8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOUQ7L0Q8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOUQ7L0Q8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOUQ7L0Q8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOUQ7L0Q8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOUQ7L0Q8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOUQ7L0Q8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RHOUQ7L0Q8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOUQ7L0Q8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOUQ7L0Q8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOUQ7L0Q8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOUQ7L0Q8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOUQ7L0Q8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOUQ7L0Q8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOUQ7L0Q8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOUQ7L0Q8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOUQ7L0Q8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOUQ7L0Q8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOUQ7L0Q8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOUQ7L0Q8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOUQ7L0Q8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOUQ7L0Q8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOUQ7L0Q8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOUQ7L0Q8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOUQ7L0Q8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOUQ7L0Q8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOUQ7L0Q8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOUQ7L0Q8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOUQ7L0Q8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOUQ7L0Q8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOUQ7L0Q8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOUQ7L0Q8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOUQ7L0Q8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOUQ7L0Q8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOUQ7L0Q8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOUQ7L0Q8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOUQ7L0Q8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOUQ7L0Q8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOUQ7L0Q8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOUQ7L0Q8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RHOUQ7L0Q8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RHOUQ7L0Q8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHOUQ7L0Q8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RHOUQ7L0Q8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHOUQ7L0Q8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHOUQ7L0Q8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHOUQ7L0Q8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHOUQ7L0Q8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOUQ7L0Q8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOUQ7L0Q8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOUQ7L0Q8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOUQ7L0Q8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOUQ7L0Q8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOUQ7L0Q8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOUQ7L0Q8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOUQ7L0Q8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOUQ7L0Q8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOUQ7L0Q8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOUQ7L0Q8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOUQ7L0Q8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOUQ7L0Q8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOUQ7L0Q8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOUQ7L0Q8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOUQ7L0Q8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOUQ7L0Q8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOUQ7L0Q8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOUQ7L0Q8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOUQ7L0Q8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOUQ7L0Q8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOUQ7L0Q8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOUQ7L0Q8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOUQ7L0Q8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOUQ7L0Q8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHOUQ7L0Q8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHOUQ7L0Q8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RHOUQ7L0Q8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHOUQ7L0Q8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
RHOUQ7L0Q8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RHOUQ7L0Q8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOUQ7L0Q8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOUQ7L0Q8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOUQ7L0Q8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOUQ7L0Q8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOUQ7L0Q8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOUQ7L0Q8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOUQ7L0Q8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOUQ7L0Q8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOUQ7L0Q8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOUQ7L0Q8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOUQ7L0Q8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOUQ7L0Q8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOUQ7L0Q8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOUQ7L0Q8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms