Protein–RNA interactions for Protein: Q70Z35

PREX2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREX2Q70Z35 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
PREX2Q70Z35 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
PREX2Q70Z35 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC39.8■■■■□ 3.96
PREX2Q70Z35 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
PREX2Q70Z35 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC39.8■■■■□ 3.96
PREX2Q70Z35 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC39.8■■■■□ 3.96
PREX2Q70Z35 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
PREX2Q70Z35 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC39.8■■■■□ 3.96
PREX2Q70Z35 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.79■■■■□ 3.96
PREX2Q70Z35 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC39.76■■■■□ 3.96
PREX2Q70Z35 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.95
PREX2Q70Z35 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC39.76■■■■□ 3.95
PREX2Q70Z35 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
PREX2Q70Z35 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.75■■■■□ 3.95
PREX2Q70Z35 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC39.74■■■■□ 3.95
PREX2Q70Z35 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.74■■■■□ 3.95
PREX2Q70Z35 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC39.73■■■■□ 3.95
PREX2Q70Z35 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
PREX2Q70Z35 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
PREX2Q70Z35 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
PREX2Q70Z35 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
PREX2Q70Z35 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.71■■■■□ 3.95
PREX2Q70Z35 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
PREX2Q70Z35 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
PREX2Q70Z35 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
PREX2Q70Z35 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
PREX2Q70Z35 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC39.7■■■■□ 3.95
PREX2Q70Z35 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC39.69■■■■□ 3.94
PREX2Q70Z35 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
PREX2Q70Z35 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC39.69■■■■□ 3.94
PREX2Q70Z35 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.68■■■■□ 3.94
PREX2Q70Z35 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC39.67■■■■□ 3.94
PREX2Q70Z35 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
PREX2Q70Z35 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
PREX2Q70Z35 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
PREX2Q70Z35 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.66■■■■□ 3.94
PREX2Q70Z35 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC39.65■■■■□ 3.94
PREX2Q70Z35 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC39.65■■■■□ 3.94
PREX2Q70Z35 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC39.65■■■■□ 3.94
PREX2Q70Z35 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
PREX2Q70Z35 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.63■■■■□ 3.94
PREX2Q70Z35 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
PREX2Q70Z35 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
PREX2Q70Z35 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.62■■■■□ 3.93
PREX2Q70Z35 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC39.62■■■■□ 3.93
PREX2Q70Z35 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
PREX2Q70Z35 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
PREX2Q70Z35 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
PREX2Q70Z35 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
PREX2Q70Z35 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
PREX2Q70Z35 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.59■■■■□ 3.93
PREX2Q70Z35 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.58■■■■□ 3.93
PREX2Q70Z35 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC39.58■■■■□ 3.93
PREX2Q70Z35 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
PREX2Q70Z35 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
PREX2Q70Z35 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.57■■■■□ 3.92
PREX2Q70Z35 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC39.56■■■■□ 3.92
PREX2Q70Z35 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC39.56■■■■□ 3.92
PREX2Q70Z35 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC39.56■■■■□ 3.92
PREX2Q70Z35 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC39.55■■■■□ 3.92
PREX2Q70Z35 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
PREX2Q70Z35 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC39.55■■■■□ 3.92
PREX2Q70Z35 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC39.55■■■■□ 3.92
PREX2Q70Z35 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
PREX2Q70Z35 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
PREX2Q70Z35 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
PREX2Q70Z35 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
PREX2Q70Z35 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC39.51■■■■□ 3.91
PREX2Q70Z35 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
PREX2Q70Z35 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
PREX2Q70Z35 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
PREX2Q70Z35 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
PREX2Q70Z35 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC39.49■■■■□ 3.91
PREX2Q70Z35 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC39.49■■■■□ 3.91
PREX2Q70Z35 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC39.49■■■■□ 3.91
PREX2Q70Z35 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
PREX2Q70Z35 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
PREX2Q70Z35 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC39.48■■■■□ 3.91
PREX2Q70Z35 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC39.48■■■■□ 3.91
PREX2Q70Z35 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC39.48■■■■□ 3.91
PREX2Q70Z35 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC39.47■■■■□ 3.91
PREX2Q70Z35 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
PREX2Q70Z35 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC39.46■■■■□ 3.91
PREX2Q70Z35 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
PREX2Q70Z35 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
PREX2Q70Z35 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.45■■■■□ 3.91
PREX2Q70Z35 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC39.44■■■■□ 3.9
PREX2Q70Z35 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
PREX2Q70Z35 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
PREX2Q70Z35 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.44■■■■□ 3.9
PREX2Q70Z35 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC39.43■■■■□ 3.9
PREX2Q70Z35 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
PREX2Q70Z35 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC39.42■■■■□ 3.9
PREX2Q70Z35 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
PREX2Q70Z35 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
PREX2Q70Z35 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
PREX2Q70Z35 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC39.4■■■■□ 3.9
PREX2Q70Z35 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
PREX2Q70Z35 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
PREX2Q70Z35 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC39.38■■■■□ 3.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms