Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ3

USP30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP30Q70CQ3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP30Q70CQ3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP30Q70CQ3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP30Q70CQ3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
USP30Q70CQ3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP30Q70CQ3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP30Q70CQ3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP30Q70CQ3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP30Q70CQ3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP30Q70CQ3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP30Q70CQ3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP30Q70CQ3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP30Q70CQ3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP30Q70CQ3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP30Q70CQ3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP30Q70CQ3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP30Q70CQ3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP30Q70CQ3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP30Q70CQ3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP30Q70CQ3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP30Q70CQ3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP30Q70CQ3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP30Q70CQ3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP30Q70CQ3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP30Q70CQ3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP30Q70CQ3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP30Q70CQ3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
USP30Q70CQ3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP30Q70CQ3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP30Q70CQ3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP30Q70CQ3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP30Q70CQ3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP30Q70CQ3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP30Q70CQ3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP30Q70CQ3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP30Q70CQ3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
USP30Q70CQ3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
USP30Q70CQ3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP30Q70CQ3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP30Q70CQ3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP30Q70CQ3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP30Q70CQ3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP30Q70CQ3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP30Q70CQ3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP30Q70CQ3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP30Q70CQ3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP30Q70CQ3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP30Q70CQ3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP30Q70CQ3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP30Q70CQ3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP30Q70CQ3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP30Q70CQ3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
USP30Q70CQ3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP30Q70CQ3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP30Q70CQ3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP30Q70CQ3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP30Q70CQ3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
USP30Q70CQ3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
USP30Q70CQ3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP30Q70CQ3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP30Q70CQ3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP30Q70CQ3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP30Q70CQ3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP30Q70CQ3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP30Q70CQ3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP30Q70CQ3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP30Q70CQ3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP30Q70CQ3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP30Q70CQ3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
USP30Q70CQ3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP30Q70CQ3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP30Q70CQ3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP30Q70CQ3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP30Q70CQ3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP30Q70CQ3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP30Q70CQ3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP30Q70CQ3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP30Q70CQ3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP30Q70CQ3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP30Q70CQ3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP30Q70CQ3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP30Q70CQ3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP30Q70CQ3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
USP30Q70CQ3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP30Q70CQ3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP30Q70CQ3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP30Q70CQ3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP30Q70CQ3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP30Q70CQ3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP30Q70CQ3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP30Q70CQ3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP30Q70CQ3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP30Q70CQ3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP30Q70CQ3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
USP30Q70CQ3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP30Q70CQ3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP30Q70CQ3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP30Q70CQ3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP30Q70CQ3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
USP30Q70CQ3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms