Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVM7

TOM1L2, TOM1-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1L2Q6ZVM7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
TOM1L2Q6ZVM7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
TOM1L2Q6ZVM7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
TOM1L2Q6ZVM7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
TOM1L2Q6ZVM7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
TOM1L2Q6ZVM7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
TOM1L2Q6ZVM7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
TOM1L2Q6ZVM7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
TOM1L2Q6ZVM7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
TOM1L2Q6ZVM7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
TOM1L2Q6ZVM7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
TOM1L2Q6ZVM7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
TOM1L2Q6ZVM7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
TOM1L2Q6ZVM7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
TOM1L2Q6ZVM7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC34.56■■■■□ 3.12
TOM1L2Q6ZVM7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
TOM1L2Q6ZVM7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
TOM1L2Q6ZVM7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
TOM1L2Q6ZVM7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
TOM1L2Q6ZVM7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
TOM1L2Q6ZVM7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
TOM1L2Q6ZVM7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
TOM1L2Q6ZVM7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
TOM1L2Q6ZVM7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
TOM1L2Q6ZVM7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
TOM1L2Q6ZVM7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC34.52■■■■□ 3.12
TOM1L2Q6ZVM7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
TOM1L2Q6ZVM7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
TOM1L2Q6ZVM7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
TOM1L2Q6ZVM7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
TOM1L2Q6ZVM7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
TOM1L2Q6ZVM7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
TOM1L2Q6ZVM7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
TOM1L2Q6ZVM7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
TOM1L2Q6ZVM7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
TOM1L2Q6ZVM7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
TOM1L2Q6ZVM7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
TOM1L2Q6ZVM7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
TOM1L2Q6ZVM7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
TOM1L2Q6ZVM7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
TOM1L2Q6ZVM7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
TOM1L2Q6ZVM7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
TOM1L2Q6ZVM7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
TOM1L2Q6ZVM7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
TOM1L2Q6ZVM7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
TOM1L2Q6ZVM7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
TOM1L2Q6ZVM7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
TOM1L2Q6ZVM7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
TOM1L2Q6ZVM7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
TOM1L2Q6ZVM7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
TOM1L2Q6ZVM7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
TOM1L2Q6ZVM7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
TOM1L2Q6ZVM7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
TOM1L2Q6ZVM7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
TOM1L2Q6ZVM7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
TOM1L2Q6ZVM7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
TOM1L2Q6ZVM7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
TOM1L2Q6ZVM7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
TOM1L2Q6ZVM7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
TOM1L2Q6ZVM7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
TOM1L2Q6ZVM7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
TOM1L2Q6ZVM7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
TOM1L2Q6ZVM7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
TOM1L2Q6ZVM7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
TOM1L2Q6ZVM7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
TOM1L2Q6ZVM7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
TOM1L2Q6ZVM7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
TOM1L2Q6ZVM7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
TOM1L2Q6ZVM7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
TOM1L2Q6ZVM7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
TOM1L2Q6ZVM7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
TOM1L2Q6ZVM7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
TOM1L2Q6ZVM7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TOM1L2Q6ZVM7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TOM1L2Q6ZVM7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TOM1L2Q6ZVM7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
TOM1L2Q6ZVM7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
TOM1L2Q6ZVM7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
TOM1L2Q6ZVM7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
TOM1L2Q6ZVM7 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
TOM1L2Q6ZVM7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
TOM1L2Q6ZVM7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
TOM1L2Q6ZVM7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
TOM1L2Q6ZVM7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
TOM1L2Q6ZVM7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
TOM1L2Q6ZVM7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
TOM1L2Q6ZVM7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
TOM1L2Q6ZVM7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
TOM1L2Q6ZVM7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
TOM1L2Q6ZVM7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
TOM1L2Q6ZVM7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
TOM1L2Q6ZVM7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
TOM1L2Q6ZVM7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
TOM1L2Q6ZVM7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
TOM1L2Q6ZVM7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
TOM1L2Q6ZVM7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
TOM1L2Q6ZVM7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
TOM1L2Q6ZVM7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
TOM1L2Q6ZVM7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
TOM1L2Q6ZVM7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms