Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSC3

RBM43, RNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM43Q6ZSC3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RBM43Q6ZSC3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RBM43Q6ZSC3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RBM43Q6ZSC3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RBM43Q6ZSC3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RBM43Q6ZSC3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RBM43Q6ZSC3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RBM43Q6ZSC3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RBM43Q6ZSC3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RBM43Q6ZSC3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RBM43Q6ZSC3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RBM43Q6ZSC3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RBM43Q6ZSC3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RBM43Q6ZSC3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RBM43Q6ZSC3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RBM43Q6ZSC3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RBM43Q6ZSC3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RBM43Q6ZSC3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RBM43Q6ZSC3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RBM43Q6ZSC3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RBM43Q6ZSC3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RBM43Q6ZSC3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RBM43Q6ZSC3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RBM43Q6ZSC3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RBM43Q6ZSC3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RBM43Q6ZSC3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RBM43Q6ZSC3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RBM43Q6ZSC3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RBM43Q6ZSC3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RBM43Q6ZSC3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RBM43Q6ZSC3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RBM43Q6ZSC3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RBM43Q6ZSC3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RBM43Q6ZSC3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RBM43Q6ZSC3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RBM43Q6ZSC3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RBM43Q6ZSC3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RBM43Q6ZSC3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
RBM43Q6ZSC3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RBM43Q6ZSC3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RBM43Q6ZSC3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RBM43Q6ZSC3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RBM43Q6ZSC3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RBM43Q6ZSC3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RBM43Q6ZSC3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RBM43Q6ZSC3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RBM43Q6ZSC3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RBM43Q6ZSC3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RBM43Q6ZSC3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RBM43Q6ZSC3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
RBM43Q6ZSC3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RBM43Q6ZSC3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RBM43Q6ZSC3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RBM43Q6ZSC3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RBM43Q6ZSC3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RBM43Q6ZSC3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RBM43Q6ZSC3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RBM43Q6ZSC3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RBM43Q6ZSC3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RBM43Q6ZSC3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RBM43Q6ZSC3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RBM43Q6ZSC3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RBM43Q6ZSC3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RBM43Q6ZSC3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
RBM43Q6ZSC3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RBM43Q6ZSC3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
RBM43Q6ZSC3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RBM43Q6ZSC3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
RBM43Q6ZSC3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RBM43Q6ZSC3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RBM43Q6ZSC3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RBM43Q6ZSC3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RBM43Q6ZSC3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RBM43Q6ZSC3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RBM43Q6ZSC3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RBM43Q6ZSC3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RBM43Q6ZSC3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RBM43Q6ZSC3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RBM43Q6ZSC3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RBM43Q6ZSC3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RBM43Q6ZSC3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RBM43Q6ZSC3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RBM43Q6ZSC3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RBM43Q6ZSC3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RBM43Q6ZSC3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RBM43Q6ZSC3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
RBM43Q6ZSC3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RBM43Q6ZSC3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RBM43Q6ZSC3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RBM43Q6ZSC3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RBM43Q6ZSC3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
RBM43Q6ZSC3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RBM43Q6ZSC3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RBM43Q6ZSC3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RBM43Q6ZSC3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
RBM43Q6ZSC3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
RBM43Q6ZSC3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
RBM43Q6ZSC3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
RBM43Q6ZSC3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RBM43Q6ZSC3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms