Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPR3

RPTN, Repetin, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPTNQ6XPR3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPTNQ6XPR3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPTNQ6XPR3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPTNQ6XPR3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPTNQ6XPR3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPTNQ6XPR3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RPTNQ6XPR3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPTNQ6XPR3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPTNQ6XPR3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RPTNQ6XPR3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPTNQ6XPR3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPTNQ6XPR3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPTNQ6XPR3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPTNQ6XPR3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPTNQ6XPR3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPTNQ6XPR3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPTNQ6XPR3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPTNQ6XPR3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPTNQ6XPR3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPTNQ6XPR3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPTNQ6XPR3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPTNQ6XPR3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPTNQ6XPR3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPTNQ6XPR3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPTNQ6XPR3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPTNQ6XPR3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPTNQ6XPR3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPTNQ6XPR3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPTNQ6XPR3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPTNQ6XPR3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPTNQ6XPR3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPTNQ6XPR3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPTNQ6XPR3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPTNQ6XPR3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPTNQ6XPR3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPTNQ6XPR3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPTNQ6XPR3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPTNQ6XPR3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPTNQ6XPR3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPTNQ6XPR3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RPTNQ6XPR3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPTNQ6XPR3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPTNQ6XPR3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPTNQ6XPR3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPTNQ6XPR3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPTNQ6XPR3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RPTNQ6XPR3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RPTNQ6XPR3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RPTNQ6XPR3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RPTNQ6XPR3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RPTNQ6XPR3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RPTNQ6XPR3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RPTNQ6XPR3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RPTNQ6XPR3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RPTNQ6XPR3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPTNQ6XPR3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPTNQ6XPR3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPTNQ6XPR3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPTNQ6XPR3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPTNQ6XPR3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPTNQ6XPR3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPTNQ6XPR3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPTNQ6XPR3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPTNQ6XPR3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPTNQ6XPR3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPTNQ6XPR3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPTNQ6XPR3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPTNQ6XPR3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPTNQ6XPR3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RPTNQ6XPR3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPTNQ6XPR3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPTNQ6XPR3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPTNQ6XPR3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPTNQ6XPR3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPTNQ6XPR3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPTNQ6XPR3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPTNQ6XPR3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPTNQ6XPR3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPTNQ6XPR3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPTNQ6XPR3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPTNQ6XPR3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPTNQ6XPR3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPTNQ6XPR3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPTNQ6XPR3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPTNQ6XPR3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPTNQ6XPR3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPTNQ6XPR3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPTNQ6XPR3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPTNQ6XPR3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPTNQ6XPR3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPTNQ6XPR3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPTNQ6XPR3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPTNQ6XPR3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPTNQ6XPR3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPTNQ6XPR3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPTNQ6XPR3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPTNQ6XPR3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPTNQ6XPR3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPTNQ6XPR3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPTNQ6XPR3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms