Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWN0

LYPD4, Ly6/PLAUR domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYPD4Q6UWN0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LYPD4Q6UWN0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LYPD4Q6UWN0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LYPD4Q6UWN0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LYPD4Q6UWN0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LYPD4Q6UWN0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LYPD4Q6UWN0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LYPD4Q6UWN0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LYPD4Q6UWN0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LYPD4Q6UWN0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LYPD4Q6UWN0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LYPD4Q6UWN0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LYPD4Q6UWN0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LYPD4Q6UWN0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LYPD4Q6UWN0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LYPD4Q6UWN0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LYPD4Q6UWN0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LYPD4Q6UWN0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LYPD4Q6UWN0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LYPD4Q6UWN0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LYPD4Q6UWN0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LYPD4Q6UWN0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LYPD4Q6UWN0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LYPD4Q6UWN0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LYPD4Q6UWN0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LYPD4Q6UWN0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LYPD4Q6UWN0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LYPD4Q6UWN0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LYPD4Q6UWN0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LYPD4Q6UWN0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LYPD4Q6UWN0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LYPD4Q6UWN0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LYPD4Q6UWN0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LYPD4Q6UWN0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LYPD4Q6UWN0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LYPD4Q6UWN0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LYPD4Q6UWN0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LYPD4Q6UWN0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LYPD4Q6UWN0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LYPD4Q6UWN0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LYPD4Q6UWN0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LYPD4Q6UWN0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LYPD4Q6UWN0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LYPD4Q6UWN0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LYPD4Q6UWN0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LYPD4Q6UWN0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LYPD4Q6UWN0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LYPD4Q6UWN0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LYPD4Q6UWN0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LYPD4Q6UWN0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LYPD4Q6UWN0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LYPD4Q6UWN0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LYPD4Q6UWN0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LYPD4Q6UWN0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LYPD4Q6UWN0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LYPD4Q6UWN0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LYPD4Q6UWN0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LYPD4Q6UWN0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LYPD4Q6UWN0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LYPD4Q6UWN0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LYPD4Q6UWN0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LYPD4Q6UWN0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LYPD4Q6UWN0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LYPD4Q6UWN0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LYPD4Q6UWN0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LYPD4Q6UWN0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LYPD4Q6UWN0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LYPD4Q6UWN0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LYPD4Q6UWN0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LYPD4Q6UWN0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LYPD4Q6UWN0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LYPD4Q6UWN0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LYPD4Q6UWN0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LYPD4Q6UWN0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LYPD4Q6UWN0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LYPD4Q6UWN0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LYPD4Q6UWN0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LYPD4Q6UWN0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LYPD4Q6UWN0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LYPD4Q6UWN0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LYPD4Q6UWN0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LYPD4Q6UWN0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LYPD4Q6UWN0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LYPD4Q6UWN0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LYPD4Q6UWN0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LYPD4Q6UWN0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LYPD4Q6UWN0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LYPD4Q6UWN0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LYPD4Q6UWN0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LYPD4Q6UWN0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LYPD4Q6UWN0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LYPD4Q6UWN0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LYPD4Q6UWN0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LYPD4Q6UWN0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LYPD4Q6UWN0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LYPD4Q6UWN0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LYPD4Q6UWN0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LYPD4Q6UWN0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LYPD4Q6UWN0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LYPD4Q6UWN0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms