Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWN0

LYPD4, Ly6/PLAUR domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYPD4Q6UWN0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LYPD4Q6UWN0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LYPD4Q6UWN0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LYPD4Q6UWN0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LYPD4Q6UWN0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LYPD4Q6UWN0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LYPD4Q6UWN0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LYPD4Q6UWN0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LYPD4Q6UWN0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LYPD4Q6UWN0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LYPD4Q6UWN0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LYPD4Q6UWN0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LYPD4Q6UWN0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LYPD4Q6UWN0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LYPD4Q6UWN0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LYPD4Q6UWN0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LYPD4Q6UWN0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LYPD4Q6UWN0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LYPD4Q6UWN0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LYPD4Q6UWN0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LYPD4Q6UWN0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LYPD4Q6UWN0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LYPD4Q6UWN0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LYPD4Q6UWN0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LYPD4Q6UWN0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LYPD4Q6UWN0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LYPD4Q6UWN0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LYPD4Q6UWN0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LYPD4Q6UWN0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LYPD4Q6UWN0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LYPD4Q6UWN0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LYPD4Q6UWN0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LYPD4Q6UWN0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LYPD4Q6UWN0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LYPD4Q6UWN0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LYPD4Q6UWN0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LYPD4Q6UWN0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LYPD4Q6UWN0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LYPD4Q6UWN0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LYPD4Q6UWN0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LYPD4Q6UWN0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LYPD4Q6UWN0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LYPD4Q6UWN0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LYPD4Q6UWN0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LYPD4Q6UWN0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LYPD4Q6UWN0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LYPD4Q6UWN0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LYPD4Q6UWN0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LYPD4Q6UWN0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LYPD4Q6UWN0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LYPD4Q6UWN0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LYPD4Q6UWN0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LYPD4Q6UWN0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LYPD4Q6UWN0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LYPD4Q6UWN0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LYPD4Q6UWN0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LYPD4Q6UWN0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LYPD4Q6UWN0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LYPD4Q6UWN0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LYPD4Q6UWN0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LYPD4Q6UWN0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LYPD4Q6UWN0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LYPD4Q6UWN0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LYPD4Q6UWN0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LYPD4Q6UWN0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LYPD4Q6UWN0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LYPD4Q6UWN0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LYPD4Q6UWN0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LYPD4Q6UWN0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LYPD4Q6UWN0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LYPD4Q6UWN0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LYPD4Q6UWN0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LYPD4Q6UWN0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LYPD4Q6UWN0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LYPD4Q6UWN0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LYPD4Q6UWN0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LYPD4Q6UWN0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LYPD4Q6UWN0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LYPD4Q6UWN0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LYPD4Q6UWN0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LYPD4Q6UWN0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LYPD4Q6UWN0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LYPD4Q6UWN0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LYPD4Q6UWN0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LYPD4Q6UWN0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LYPD4Q6UWN0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LYPD4Q6UWN0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LYPD4Q6UWN0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LYPD4Q6UWN0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LYPD4Q6UWN0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LYPD4Q6UWN0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LYPD4Q6UWN0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LYPD4Q6UWN0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LYPD4Q6UWN0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LYPD4Q6UWN0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LYPD4Q6UWN0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LYPD4Q6UWN0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LYPD4Q6UWN0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LYPD4Q6UWN0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LYPD4Q6UWN0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms