Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRIP3Q6Q6R5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRIP3Q6Q6R5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRIP3Q6Q6R5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRIP3Q6Q6R5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRIP3Q6Q6R5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRIP3Q6Q6R5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRIP3Q6Q6R5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRIP3Q6Q6R5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRIP3Q6Q6R5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CRIP3Q6Q6R5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRIP3Q6Q6R5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRIP3Q6Q6R5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRIP3Q6Q6R5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRIP3Q6Q6R5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CRIP3Q6Q6R5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRIP3Q6Q6R5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRIP3Q6Q6R5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRIP3Q6Q6R5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRIP3Q6Q6R5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRIP3Q6Q6R5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRIP3Q6Q6R5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRIP3Q6Q6R5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRIP3Q6Q6R5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRIP3Q6Q6R5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRIP3Q6Q6R5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRIP3Q6Q6R5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRIP3Q6Q6R5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRIP3Q6Q6R5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRIP3Q6Q6R5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRIP3Q6Q6R5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRIP3Q6Q6R5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRIP3Q6Q6R5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRIP3Q6Q6R5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRIP3Q6Q6R5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRIP3Q6Q6R5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRIP3Q6Q6R5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRIP3Q6Q6R5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRIP3Q6Q6R5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRIP3Q6Q6R5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRIP3Q6Q6R5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRIP3Q6Q6R5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRIP3Q6Q6R5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRIP3Q6Q6R5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRIP3Q6Q6R5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CRIP3Q6Q6R5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CRIP3Q6Q6R5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CRIP3Q6Q6R5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRIP3Q6Q6R5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRIP3Q6Q6R5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRIP3Q6Q6R5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRIP3Q6Q6R5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRIP3Q6Q6R5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRIP3Q6Q6R5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRIP3Q6Q6R5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRIP3Q6Q6R5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRIP3Q6Q6R5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRIP3Q6Q6R5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRIP3Q6Q6R5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRIP3Q6Q6R5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRIP3Q6Q6R5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRIP3Q6Q6R5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRIP3Q6Q6R5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRIP3Q6Q6R5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CRIP3Q6Q6R5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRIP3Q6Q6R5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRIP3Q6Q6R5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CRIP3Q6Q6R5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRIP3Q6Q6R5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRIP3Q6Q6R5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRIP3Q6Q6R5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CRIP3Q6Q6R5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRIP3Q6Q6R5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRIP3Q6Q6R5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CRIP3Q6Q6R5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CRIP3Q6Q6R5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CRIP3Q6Q6R5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRIP3Q6Q6R5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CRIP3Q6Q6R5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRIP3Q6Q6R5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRIP3Q6Q6R5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRIP3Q6Q6R5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRIP3Q6Q6R5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CRIP3Q6Q6R5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRIP3Q6Q6R5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRIP3Q6Q6R5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRIP3Q6Q6R5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRIP3Q6Q6R5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRIP3Q6Q6R5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRIP3Q6Q6R5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CRIP3Q6Q6R5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRIP3Q6Q6R5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CRIP3Q6Q6R5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRIP3Q6Q6R5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRIP3Q6Q6R5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CRIP3Q6Q6R5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRIP3Q6Q6R5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CRIP3Q6Q6R5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRIP3Q6Q6R5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRIP3Q6Q6R5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms