Protein–RNA interactions for Protein: Q6BDI9

REP15, Rab15 effector protein, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REP15Q6BDI9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
REP15Q6BDI9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
REP15Q6BDI9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
REP15Q6BDI9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
REP15Q6BDI9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
REP15Q6BDI9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
REP15Q6BDI9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
REP15Q6BDI9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
REP15Q6BDI9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
REP15Q6BDI9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
REP15Q6BDI9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
REP15Q6BDI9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
REP15Q6BDI9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
REP15Q6BDI9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
REP15Q6BDI9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
REP15Q6BDI9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
REP15Q6BDI9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
REP15Q6BDI9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
REP15Q6BDI9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
REP15Q6BDI9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
REP15Q6BDI9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
REP15Q6BDI9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
REP15Q6BDI9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
REP15Q6BDI9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
REP15Q6BDI9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
REP15Q6BDI9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
REP15Q6BDI9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
REP15Q6BDI9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
REP15Q6BDI9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
REP15Q6BDI9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
REP15Q6BDI9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
REP15Q6BDI9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
REP15Q6BDI9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
REP15Q6BDI9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
REP15Q6BDI9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
REP15Q6BDI9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
REP15Q6BDI9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
REP15Q6BDI9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
REP15Q6BDI9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
REP15Q6BDI9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
REP15Q6BDI9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
REP15Q6BDI9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
REP15Q6BDI9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
REP15Q6BDI9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
REP15Q6BDI9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
REP15Q6BDI9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
REP15Q6BDI9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
REP15Q6BDI9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
REP15Q6BDI9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
REP15Q6BDI9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
REP15Q6BDI9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
REP15Q6BDI9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
REP15Q6BDI9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
REP15Q6BDI9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
REP15Q6BDI9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
REP15Q6BDI9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
REP15Q6BDI9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
REP15Q6BDI9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
REP15Q6BDI9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
REP15Q6BDI9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
REP15Q6BDI9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
REP15Q6BDI9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
REP15Q6BDI9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
REP15Q6BDI9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
REP15Q6BDI9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
REP15Q6BDI9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
REP15Q6BDI9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
REP15Q6BDI9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
REP15Q6BDI9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
REP15Q6BDI9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
REP15Q6BDI9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
REP15Q6BDI9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
REP15Q6BDI9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
REP15Q6BDI9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
REP15Q6BDI9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
REP15Q6BDI9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
REP15Q6BDI9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
REP15Q6BDI9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
REP15Q6BDI9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
REP15Q6BDI9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
REP15Q6BDI9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
REP15Q6BDI9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
REP15Q6BDI9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
REP15Q6BDI9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
REP15Q6BDI9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
REP15Q6BDI9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
REP15Q6BDI9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
REP15Q6BDI9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
REP15Q6BDI9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
REP15Q6BDI9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
REP15Q6BDI9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
REP15Q6BDI9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
REP15Q6BDI9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
REP15Q6BDI9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
REP15Q6BDI9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
REP15Q6BDI9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
REP15Q6BDI9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
REP15Q6BDI9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
REP15Q6BDI9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
REP15Q6BDI9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms