Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ1

RPGRIP1L, Protein fantom, humanhuman

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPGRIP1LQ68CZ1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
RPGRIP1LQ68CZ1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
RPGRIP1LQ68CZ1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC37.09■■■■□ 3.53
RPGRIP1LQ68CZ1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
RPGRIP1LQ68CZ1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
RPGRIP1LQ68CZ1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
RPGRIP1LQ68CZ1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
RPGRIP1LQ68CZ1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
RPGRIP1LQ68CZ1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
RPGRIP1LQ68CZ1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
RPGRIP1LQ68CZ1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
RPGRIP1LQ68CZ1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
RPGRIP1LQ68CZ1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
RPGRIP1LQ68CZ1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
RPGRIP1LQ68CZ1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
RPGRIP1LQ68CZ1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC37.06■■■■□ 3.52
RPGRIP1LQ68CZ1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
RPGRIP1LQ68CZ1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
RPGRIP1LQ68CZ1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
RPGRIP1LQ68CZ1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
RPGRIP1LQ68CZ1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
RPGRIP1LQ68CZ1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
RPGRIP1LQ68CZ1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
RPGRIP1LQ68CZ1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
RPGRIP1LQ68CZ1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
RPGRIP1LQ68CZ1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC37■■■■□ 3.51
RPGRIP1LQ68CZ1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
RPGRIP1LQ68CZ1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
RPGRIP1LQ68CZ1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC37■■■■□ 3.51
RPGRIP1LQ68CZ1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC37■■■■□ 3.51
RPGRIP1LQ68CZ1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC37■■■■□ 3.51
RPGRIP1LQ68CZ1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
RPGRIP1LQ68CZ1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
RPGRIP1LQ68CZ1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
RPGRIP1LQ68CZ1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.98■■■■□ 3.51
RPGRIP1LQ68CZ1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
RPGRIP1LQ68CZ1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
RPGRIP1LQ68CZ1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC36.97■■■■□ 3.51
RPGRIP1LQ68CZ1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC36.97■■■■□ 3.51
RPGRIP1LQ68CZ1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
RPGRIP1LQ68CZ1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC36.96■■■■□ 3.51
RPGRIP1LQ68CZ1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
RPGRIP1LQ68CZ1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
RPGRIP1LQ68CZ1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC36.95■■■■□ 3.51
RPGRIP1LQ68CZ1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
RPGRIP1LQ68CZ1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
RPGRIP1LQ68CZ1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
RPGRIP1LQ68CZ1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
RPGRIP1LQ68CZ1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
RPGRIP1LQ68CZ1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
RPGRIP1LQ68CZ1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
RPGRIP1LQ68CZ1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
RPGRIP1LQ68CZ1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
RPGRIP1LQ68CZ1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
RPGRIP1LQ68CZ1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
RPGRIP1LQ68CZ1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
RPGRIP1LQ68CZ1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
RPGRIP1LQ68CZ1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
RPGRIP1LQ68CZ1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
RPGRIP1LQ68CZ1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
RPGRIP1LQ68CZ1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
RPGRIP1LQ68CZ1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
RPGRIP1LQ68CZ1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
RPGRIP1LQ68CZ1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
RPGRIP1LQ68CZ1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
RPGRIP1LQ68CZ1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
RPGRIP1LQ68CZ1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
RPGRIP1LQ68CZ1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
RPGRIP1LQ68CZ1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
RPGRIP1LQ68CZ1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
RPGRIP1LQ68CZ1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
RPGRIP1LQ68CZ1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
RPGRIP1LQ68CZ1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
RPGRIP1LQ68CZ1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
RPGRIP1LQ68CZ1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC36.82■■■■□ 3.49
RPGRIP1LQ68CZ1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
RPGRIP1LQ68CZ1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
RPGRIP1LQ68CZ1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
RPGRIP1LQ68CZ1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
RPGRIP1LQ68CZ1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
RPGRIP1LQ68CZ1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
RPGRIP1LQ68CZ1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
RPGRIP1LQ68CZ1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
RPGRIP1LQ68CZ1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
RPGRIP1LQ68CZ1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC36.79■■■■□ 3.48
RPGRIP1LQ68CZ1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
RPGRIP1LQ68CZ1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
RPGRIP1LQ68CZ1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
RPGRIP1LQ68CZ1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
RPGRIP1LQ68CZ1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC36.78■■■■□ 3.48
RPGRIP1LQ68CZ1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC36.76■■■■□ 3.47
RPGRIP1LQ68CZ1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
RPGRIP1LQ68CZ1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
RPGRIP1LQ68CZ1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
RPGRIP1LQ68CZ1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
RPGRIP1LQ68CZ1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC36.74■■■■□ 3.47
RPGRIP1LQ68CZ1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
RPGRIP1LQ68CZ1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
RPGRIP1LQ68CZ1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
RPGRIP1LQ68CZ1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC36.72■■■■□ 3.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms