Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM6

PRAMEF13, Putative PRAME family member 13, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF13Q5VWM6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRAMEF13Q5VWM6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRAMEF13Q5VWM6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRAMEF13Q5VWM6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRAMEF13Q5VWM6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRAMEF13Q5VWM6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRAMEF13Q5VWM6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRAMEF13Q5VWM6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRAMEF13Q5VWM6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRAMEF13Q5VWM6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRAMEF13Q5VWM6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRAMEF13Q5VWM6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRAMEF13Q5VWM6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRAMEF13Q5VWM6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRAMEF13Q5VWM6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PRAMEF13Q5VWM6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRAMEF13Q5VWM6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRAMEF13Q5VWM6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRAMEF13Q5VWM6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRAMEF13Q5VWM6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRAMEF13Q5VWM6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRAMEF13Q5VWM6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRAMEF13Q5VWM6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PRAMEF13Q5VWM6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRAMEF13Q5VWM6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRAMEF13Q5VWM6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRAMEF13Q5VWM6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRAMEF13Q5VWM6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRAMEF13Q5VWM6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRAMEF13Q5VWM6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRAMEF13Q5VWM6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRAMEF13Q5VWM6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRAMEF13Q5VWM6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRAMEF13Q5VWM6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRAMEF13Q5VWM6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRAMEF13Q5VWM6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRAMEF13Q5VWM6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRAMEF13Q5VWM6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRAMEF13Q5VWM6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRAMEF13Q5VWM6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRAMEF13Q5VWM6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRAMEF13Q5VWM6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRAMEF13Q5VWM6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PRAMEF13Q5VWM6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRAMEF13Q5VWM6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRAMEF13Q5VWM6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRAMEF13Q5VWM6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRAMEF13Q5VWM6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRAMEF13Q5VWM6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRAMEF13Q5VWM6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRAMEF13Q5VWM6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRAMEF13Q5VWM6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRAMEF13Q5VWM6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PRAMEF13Q5VWM6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRAMEF13Q5VWM6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRAMEF13Q5VWM6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRAMEF13Q5VWM6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PRAMEF13Q5VWM6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRAMEF13Q5VWM6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRAMEF13Q5VWM6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRAMEF13Q5VWM6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRAMEF13Q5VWM6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRAMEF13Q5VWM6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRAMEF13Q5VWM6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRAMEF13Q5VWM6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRAMEF13Q5VWM6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRAMEF13Q5VWM6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRAMEF13Q5VWM6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRAMEF13Q5VWM6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PRAMEF13Q5VWM6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRAMEF13Q5VWM6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRAMEF13Q5VWM6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAMEF13Q5VWM6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAMEF13Q5VWM6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAMEF13Q5VWM6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAMEF13Q5VWM6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRAMEF13Q5VWM6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRAMEF13Q5VWM6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRAMEF13Q5VWM6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRAMEF13Q5VWM6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRAMEF13Q5VWM6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRAMEF13Q5VWM6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRAMEF13Q5VWM6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRAMEF13Q5VWM6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PRAMEF13Q5VWM6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRAMEF13Q5VWM6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRAMEF13Q5VWM6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRAMEF13Q5VWM6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRAMEF13Q5VWM6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRAMEF13Q5VWM6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRAMEF13Q5VWM6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRAMEF13Q5VWM6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRAMEF13Q5VWM6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRAMEF13Q5VWM6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRAMEF13Q5VWM6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRAMEF13Q5VWM6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRAMEF13Q5VWM6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRAMEF13Q5VWM6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRAMEF13Q5VWM6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRAMEF13Q5VWM6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms