Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU43

PDE4DIP, Myomegalin, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DIPQ5VU43 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PDE4DIPQ5VU43 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
PDE4DIPQ5VU43 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PDE4DIPQ5VU43 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PDE4DIPQ5VU43 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PDE4DIPQ5VU43 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PDE4DIPQ5VU43 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PDE4DIPQ5VU43 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PDE4DIPQ5VU43 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PDE4DIPQ5VU43 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PDE4DIPQ5VU43 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
PDE4DIPQ5VU43 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PDE4DIPQ5VU43 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PDE4DIPQ5VU43 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PDE4DIPQ5VU43 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
PDE4DIPQ5VU43 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PDE4DIPQ5VU43 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PDE4DIPQ5VU43 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PDE4DIPQ5VU43 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PDE4DIPQ5VU43 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PDE4DIPQ5VU43 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PDE4DIPQ5VU43 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PDE4DIPQ5VU43 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PDE4DIPQ5VU43 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PDE4DIPQ5VU43 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PDE4DIPQ5VU43 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PDE4DIPQ5VU43 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PDE4DIPQ5VU43 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PDE4DIPQ5VU43 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PDE4DIPQ5VU43 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PDE4DIPQ5VU43 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PDE4DIPQ5VU43 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PDE4DIPQ5VU43 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PDE4DIPQ5VU43 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PDE4DIPQ5VU43 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PDE4DIPQ5VU43 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PDE4DIPQ5VU43 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PDE4DIPQ5VU43 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PDE4DIPQ5VU43 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDE4DIPQ5VU43 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PDE4DIPQ5VU43 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PDE4DIPQ5VU43 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PDE4DIPQ5VU43 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PDE4DIPQ5VU43 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PDE4DIPQ5VU43 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PDE4DIPQ5VU43 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PDE4DIPQ5VU43 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDE4DIPQ5VU43 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDE4DIPQ5VU43 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDE4DIPQ5VU43 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PDE4DIPQ5VU43 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PDE4DIPQ5VU43 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PDE4DIPQ5VU43 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PDE4DIPQ5VU43 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PDE4DIPQ5VU43 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PDE4DIPQ5VU43 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PDE4DIPQ5VU43 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PDE4DIPQ5VU43 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PDE4DIPQ5VU43 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PDE4DIPQ5VU43 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PDE4DIPQ5VU43 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PDE4DIPQ5VU43 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PDE4DIPQ5VU43 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
PDE4DIPQ5VU43 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PDE4DIPQ5VU43 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PDE4DIPQ5VU43 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PDE4DIPQ5VU43 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PDE4DIPQ5VU43 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PDE4DIPQ5VU43 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PDE4DIPQ5VU43 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PDE4DIPQ5VU43 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PDE4DIPQ5VU43 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PDE4DIPQ5VU43 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDE4DIPQ5VU43 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDE4DIPQ5VU43 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDE4DIPQ5VU43 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDE4DIPQ5VU43 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PDE4DIPQ5VU43 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDE4DIPQ5VU43 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PDE4DIPQ5VU43 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PDE4DIPQ5VU43 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PDE4DIPQ5VU43 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PDE4DIPQ5VU43 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PDE4DIPQ5VU43 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PDE4DIPQ5VU43 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PDE4DIPQ5VU43 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PDE4DIPQ5VU43 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PDE4DIPQ5VU43 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PDE4DIPQ5VU43 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PDE4DIPQ5VU43 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDE4DIPQ5VU43 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDE4DIPQ5VU43 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDE4DIPQ5VU43 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDE4DIPQ5VU43 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDE4DIPQ5VU43 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDE4DIPQ5VU43 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PDE4DIPQ5VU43 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PDE4DIPQ5VU43 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
PDE4DIPQ5VU43 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PDE4DIPQ5VU43 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms