Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGU0

TSPO2, Translocator protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPO2Q5TGU0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSPO2Q5TGU0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSPO2Q5TGU0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPO2Q5TGU0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPO2Q5TGU0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPO2Q5TGU0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPO2Q5TGU0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPO2Q5TGU0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPO2Q5TGU0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPO2Q5TGU0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPO2Q5TGU0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPO2Q5TGU0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPO2Q5TGU0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPO2Q5TGU0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPO2Q5TGU0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPO2Q5TGU0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPO2Q5TGU0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPO2Q5TGU0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPO2Q5TGU0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPO2Q5TGU0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPO2Q5TGU0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSPO2Q5TGU0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSPO2Q5TGU0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSPO2Q5TGU0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSPO2Q5TGU0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSPO2Q5TGU0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSPO2Q5TGU0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSPO2Q5TGU0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSPO2Q5TGU0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSPO2Q5TGU0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSPO2Q5TGU0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSPO2Q5TGU0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPO2Q5TGU0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPO2Q5TGU0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPO2Q5TGU0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPO2Q5TGU0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPO2Q5TGU0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPO2Q5TGU0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPO2Q5TGU0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPO2Q5TGU0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPO2Q5TGU0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPO2Q5TGU0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPO2Q5TGU0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPO2Q5TGU0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPO2Q5TGU0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPO2Q5TGU0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPO2Q5TGU0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSPO2Q5TGU0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSPO2Q5TGU0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSPO2Q5TGU0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPO2Q5TGU0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPO2Q5TGU0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPO2Q5TGU0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPO2Q5TGU0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPO2Q5TGU0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPO2Q5TGU0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPO2Q5TGU0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPO2Q5TGU0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPO2Q5TGU0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPO2Q5TGU0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPO2Q5TGU0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPO2Q5TGU0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPO2Q5TGU0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPO2Q5TGU0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPO2Q5TGU0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPO2Q5TGU0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPO2Q5TGU0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPO2Q5TGU0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSPO2Q5TGU0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSPO2Q5TGU0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSPO2Q5TGU0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSPO2Q5TGU0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPO2Q5TGU0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPO2Q5TGU0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPO2Q5TGU0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPO2Q5TGU0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPO2Q5TGU0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPO2Q5TGU0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPO2Q5TGU0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSPO2Q5TGU0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSPO2Q5TGU0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSPO2Q5TGU0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSPO2Q5TGU0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSPO2Q5TGU0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSPO2Q5TGU0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSPO2Q5TGU0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TSPO2Q5TGU0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPO2Q5TGU0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPO2Q5TGU0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPO2Q5TGU0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPO2Q5TGU0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPO2Q5TGU0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPO2Q5TGU0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPO2Q5TGU0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPO2Q5TGU0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPO2Q5TGU0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPO2Q5TGU0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPO2Q5TGU0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPO2Q5TGU0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPO2Q5TGU0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 163.3 ms