Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
SOGA3Q5TF21 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SOGA3Q5TF21 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
SOGA3Q5TF21 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SOGA3Q5TF21 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SOGA3Q5TF21 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SOGA3Q5TF21 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
SOGA3Q5TF21 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
SOGA3Q5TF21 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
SOGA3Q5TF21 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.7
SOGA3Q5TF21 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SOGA3Q5TF21 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SOGA3Q5TF21 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
SOGA3Q5TF21 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
SOGA3Q5TF21 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
SOGA3Q5TF21 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
SOGA3Q5TF21 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
SOGA3Q5TF21 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
SOGA3Q5TF21 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
SOGA3Q5TF21 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
SOGA3Q5TF21 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
SOGA3Q5TF21 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
SOGA3Q5TF21 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
SOGA3Q5TF21 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC31.9■■■□□ 2.7
SOGA3Q5TF21 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
SOGA3Q5TF21 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
SOGA3Q5TF21 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
SOGA3Q5TF21 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
SOGA3Q5TF21 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
SOGA3Q5TF21 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
SOGA3Q5TF21 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
SOGA3Q5TF21 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
SOGA3Q5TF21 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
SOGA3Q5TF21 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
SOGA3Q5TF21 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
SOGA3Q5TF21 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
SOGA3Q5TF21 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
SOGA3Q5TF21 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
SOGA3Q5TF21 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
SOGA3Q5TF21 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
SOGA3Q5TF21 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
SOGA3Q5TF21 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
SOGA3Q5TF21 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
SOGA3Q5TF21 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
SOGA3Q5TF21 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.69
SOGA3Q5TF21 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
SOGA3Q5TF21 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
SOGA3Q5TF21 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
SOGA3Q5TF21 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
SOGA3Q5TF21 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
SOGA3Q5TF21 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
SOGA3Q5TF21 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
SOGA3Q5TF21 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
SOGA3Q5TF21 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
SOGA3Q5TF21 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
SOGA3Q5TF21 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
SOGA3Q5TF21 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
SOGA3Q5TF21 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
SOGA3Q5TF21 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
SOGA3Q5TF21 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
SOGA3Q5TF21 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
SOGA3Q5TF21 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
SOGA3Q5TF21 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
SOGA3Q5TF21 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
SOGA3Q5TF21 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
SOGA3Q5TF21 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
SOGA3Q5TF21 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
SOGA3Q5TF21 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC31.76■■■□□ 2.68
SOGA3Q5TF21 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
SOGA3Q5TF21 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SOGA3Q5TF21 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SOGA3Q5TF21 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
SOGA3Q5TF21 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
SOGA3Q5TF21 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
SOGA3Q5TF21 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
SOGA3Q5TF21 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
SOGA3Q5TF21 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
SOGA3Q5TF21 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
SOGA3Q5TF21 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SOGA3Q5TF21 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SOGA3Q5TF21 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SOGA3Q5TF21 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SOGA3Q5TF21 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SOGA3Q5TF21 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
SOGA3Q5TF21 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
SOGA3Q5TF21 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
SOGA3Q5TF21 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
SOGA3Q5TF21 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
SOGA3Q5TF21 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
SOGA3Q5TF21 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
SOGA3Q5TF21 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
SOGA3Q5TF21 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
SOGA3Q5TF21 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
SOGA3Q5TF21 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
SOGA3Q5TF21 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SOGA3Q5TF21 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
SOGA3Q5TF21 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SOGA3Q5TF21 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
SOGA3Q5TF21 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
SOGA3Q5TF21 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms