Protein–RNA interactions for Protein: Q5T200

ZC3H13, Zinc finger CCCH domain-containing protein 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H13Q5T200 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.72
ZC3H13Q5T200 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
ZC3H13Q5T200 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC38.25■■■■□ 3.71
ZC3H13Q5T200 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
ZC3H13Q5T200 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
ZC3H13Q5T200 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
ZC3H13Q5T200 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
ZC3H13Q5T200 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
ZC3H13Q5T200 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
ZC3H13Q5T200 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
ZC3H13Q5T200 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
ZC3H13Q5T200 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
ZC3H13Q5T200 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
ZC3H13Q5T200 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
ZC3H13Q5T200 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
ZC3H13Q5T200 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
ZC3H13Q5T200 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
ZC3H13Q5T200 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
ZC3H13Q5T200 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
ZC3H13Q5T200 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC38.17■■■■□ 3.7
ZC3H13Q5T200 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
ZC3H13Q5T200 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
ZC3H13Q5T200 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
ZC3H13Q5T200 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
ZC3H13Q5T200 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
ZC3H13Q5T200 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
ZC3H13Q5T200 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
ZC3H13Q5T200 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
ZC3H13Q5T200 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC38.14■■■■□ 3.7
ZC3H13Q5T200 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC38.14■■■■□ 3.7
ZC3H13Q5T200 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC38.13■■■■□ 3.7
ZC3H13Q5T200 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
ZC3H13Q5T200 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
ZC3H13Q5T200 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC38.11■■■■□ 3.69
ZC3H13Q5T200 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
ZC3H13Q5T200 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
ZC3H13Q5T200 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
ZC3H13Q5T200 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
ZC3H13Q5T200 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC38.09■■■■□ 3.69
ZC3H13Q5T200 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC38.09■■■■□ 3.69
ZC3H13Q5T200 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
ZC3H13Q5T200 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
ZC3H13Q5T200 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
ZC3H13Q5T200 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
ZC3H13Q5T200 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
ZC3H13Q5T200 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
ZC3H13Q5T200 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.69
ZC3H13Q5T200 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.68
ZC3H13Q5T200 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
ZC3H13Q5T200 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
ZC3H13Q5T200 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
ZC3H13Q5T200 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
ZC3H13Q5T200 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
ZC3H13Q5T200 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
ZC3H13Q5T200 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
ZC3H13Q5T200 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
ZC3H13Q5T200 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
ZC3H13Q5T200 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
ZC3H13Q5T200 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
ZC3H13Q5T200 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC38.03■■■■□ 3.68
ZC3H13Q5T200 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
ZC3H13Q5T200 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC38.02■■■■□ 3.68
ZC3H13Q5T200 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.67
ZC3H13Q5T200 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.67
ZC3H13Q5T200 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.67
ZC3H13Q5T200 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
ZC3H13Q5T200 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
ZC3H13Q5T200 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
ZC3H13Q5T200 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
ZC3H13Q5T200 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
ZC3H13Q5T200 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC37.98■■■■□ 3.67
ZC3H13Q5T200 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
ZC3H13Q5T200 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
ZC3H13Q5T200 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
ZC3H13Q5T200 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
ZC3H13Q5T200 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
ZC3H13Q5T200 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
ZC3H13Q5T200 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
ZC3H13Q5T200 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
ZC3H13Q5T200 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
ZC3H13Q5T200 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
ZC3H13Q5T200 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
ZC3H13Q5T200 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC37.91■■■■□ 3.66
ZC3H13Q5T200 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
ZC3H13Q5T200 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
ZC3H13Q5T200 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
ZC3H13Q5T200 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
ZC3H13Q5T200 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
ZC3H13Q5T200 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
ZC3H13Q5T200 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
ZC3H13Q5T200 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
ZC3H13Q5T200 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
ZC3H13Q5T200 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
ZC3H13Q5T200 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
ZC3H13Q5T200 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
ZC3H13Q5T200 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
ZC3H13Q5T200 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
ZC3H13Q5T200 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.85■■■■□ 3.65
ZC3H13Q5T200 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
ZC3H13Q5T200 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms