Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRD0

WASHC2D, WASH complex subunit 2D, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2DQ5SRD0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
WASHC2DQ5SRD0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
WASHC2DQ5SRD0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
WASHC2DQ5SRD0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
WASHC2DQ5SRD0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
WASHC2DQ5SRD0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
WASHC2DQ5SRD0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
WASHC2DQ5SRD0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
WASHC2DQ5SRD0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
WASHC2DQ5SRD0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
WASHC2DQ5SRD0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
WASHC2DQ5SRD0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
WASHC2DQ5SRD0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
WASHC2DQ5SRD0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
WASHC2DQ5SRD0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
WASHC2DQ5SRD0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
WASHC2DQ5SRD0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
WASHC2DQ5SRD0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
WASHC2DQ5SRD0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
WASHC2DQ5SRD0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
WASHC2DQ5SRD0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
WASHC2DQ5SRD0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
WASHC2DQ5SRD0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
WASHC2DQ5SRD0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
WASHC2DQ5SRD0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
WASHC2DQ5SRD0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
WASHC2DQ5SRD0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
WASHC2DQ5SRD0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
WASHC2DQ5SRD0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
WASHC2DQ5SRD0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
WASHC2DQ5SRD0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
WASHC2DQ5SRD0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
WASHC2DQ5SRD0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
WASHC2DQ5SRD0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
WASHC2DQ5SRD0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
WASHC2DQ5SRD0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
WASHC2DQ5SRD0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
WASHC2DQ5SRD0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
WASHC2DQ5SRD0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
WASHC2DQ5SRD0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
WASHC2DQ5SRD0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
WASHC2DQ5SRD0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
WASHC2DQ5SRD0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
WASHC2DQ5SRD0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
WASHC2DQ5SRD0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
WASHC2DQ5SRD0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
WASHC2DQ5SRD0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
WASHC2DQ5SRD0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
WASHC2DQ5SRD0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
WASHC2DQ5SRD0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
WASHC2DQ5SRD0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
WASHC2DQ5SRD0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
WASHC2DQ5SRD0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
WASHC2DQ5SRD0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
WASHC2DQ5SRD0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
WASHC2DQ5SRD0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
WASHC2DQ5SRD0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
WASHC2DQ5SRD0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
WASHC2DQ5SRD0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
WASHC2DQ5SRD0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
WASHC2DQ5SRD0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
WASHC2DQ5SRD0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
WASHC2DQ5SRD0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
WASHC2DQ5SRD0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
WASHC2DQ5SRD0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
WASHC2DQ5SRD0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
WASHC2DQ5SRD0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
WASHC2DQ5SRD0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
WASHC2DQ5SRD0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
WASHC2DQ5SRD0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
WASHC2DQ5SRD0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
WASHC2DQ5SRD0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
WASHC2DQ5SRD0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
WASHC2DQ5SRD0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
WASHC2DQ5SRD0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
WASHC2DQ5SRD0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
WASHC2DQ5SRD0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
WASHC2DQ5SRD0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
WASHC2DQ5SRD0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
WASHC2DQ5SRD0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
WASHC2DQ5SRD0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
WASHC2DQ5SRD0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
WASHC2DQ5SRD0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
WASHC2DQ5SRD0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
WASHC2DQ5SRD0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
WASHC2DQ5SRD0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
WASHC2DQ5SRD0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
WASHC2DQ5SRD0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
WASHC2DQ5SRD0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
WASHC2DQ5SRD0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
WASHC2DQ5SRD0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
WASHC2DQ5SRD0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
WASHC2DQ5SRD0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
WASHC2DQ5SRD0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
WASHC2DQ5SRD0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
WASHC2DQ5SRD0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
WASHC2DQ5SRD0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
WASHC2DQ5SRD0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
WASHC2DQ5SRD0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
WASHC2DQ5SRD0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms