Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBM0

CMPK2, UMP-CMP kinase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK2Q5EBM0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CMPK2Q5EBM0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CMPK2Q5EBM0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CMPK2Q5EBM0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CMPK2Q5EBM0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CMPK2Q5EBM0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CMPK2Q5EBM0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CMPK2Q5EBM0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CMPK2Q5EBM0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CMPK2Q5EBM0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CMPK2Q5EBM0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CMPK2Q5EBM0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CMPK2Q5EBM0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CMPK2Q5EBM0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CMPK2Q5EBM0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CMPK2Q5EBM0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CMPK2Q5EBM0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CMPK2Q5EBM0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CMPK2Q5EBM0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CMPK2Q5EBM0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CMPK2Q5EBM0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CMPK2Q5EBM0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CMPK2Q5EBM0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CMPK2Q5EBM0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CMPK2Q5EBM0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CMPK2Q5EBM0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CMPK2Q5EBM0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CMPK2Q5EBM0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CMPK2Q5EBM0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CMPK2Q5EBM0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CMPK2Q5EBM0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CMPK2Q5EBM0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CMPK2Q5EBM0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CMPK2Q5EBM0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CMPK2Q5EBM0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CMPK2Q5EBM0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CMPK2Q5EBM0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CMPK2Q5EBM0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CMPK2Q5EBM0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CMPK2Q5EBM0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CMPK2Q5EBM0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CMPK2Q5EBM0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CMPK2Q5EBM0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CMPK2Q5EBM0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CMPK2Q5EBM0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CMPK2Q5EBM0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CMPK2Q5EBM0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CMPK2Q5EBM0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CMPK2Q5EBM0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CMPK2Q5EBM0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CMPK2Q5EBM0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CMPK2Q5EBM0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CMPK2Q5EBM0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CMPK2Q5EBM0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CMPK2Q5EBM0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CMPK2Q5EBM0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CMPK2Q5EBM0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CMPK2Q5EBM0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CMPK2Q5EBM0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CMPK2Q5EBM0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CMPK2Q5EBM0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CMPK2Q5EBM0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CMPK2Q5EBM0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CMPK2Q5EBM0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CMPK2Q5EBM0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CMPK2Q5EBM0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CMPK2Q5EBM0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CMPK2Q5EBM0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CMPK2Q5EBM0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CMPK2Q5EBM0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CMPK2Q5EBM0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CMPK2Q5EBM0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CMPK2Q5EBM0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CMPK2Q5EBM0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CMPK2Q5EBM0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CMPK2Q5EBM0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CMPK2Q5EBM0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CMPK2Q5EBM0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CMPK2Q5EBM0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CMPK2Q5EBM0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CMPK2Q5EBM0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CMPK2Q5EBM0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CMPK2Q5EBM0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CMPK2Q5EBM0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CMPK2Q5EBM0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CMPK2Q5EBM0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CMPK2Q5EBM0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CMPK2Q5EBM0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CMPK2Q5EBM0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CMPK2Q5EBM0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CMPK2Q5EBM0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CMPK2Q5EBM0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CMPK2Q5EBM0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CMPK2Q5EBM0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CMPK2Q5EBM0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CMPK2Q5EBM0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CMPK2Q5EBM0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CMPK2Q5EBM0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CMPK2Q5EBM0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CMPK2Q5EBM0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms