Protein–RNA interactions for Protein: Q562F6

SGO2, Shugoshin 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO2Q562F6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SGO2Q562F6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SGO2Q562F6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SGO2Q562F6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SGO2Q562F6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SGO2Q562F6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SGO2Q562F6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SGO2Q562F6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SGO2Q562F6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SGO2Q562F6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SGO2Q562F6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SGO2Q562F6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SGO2Q562F6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SGO2Q562F6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SGO2Q562F6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SGO2Q562F6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SGO2Q562F6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SGO2Q562F6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SGO2Q562F6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SGO2Q562F6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SGO2Q562F6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SGO2Q562F6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SGO2Q562F6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SGO2Q562F6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SGO2Q562F6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SGO2Q562F6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SGO2Q562F6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SGO2Q562F6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SGO2Q562F6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SGO2Q562F6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SGO2Q562F6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SGO2Q562F6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SGO2Q562F6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SGO2Q562F6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SGO2Q562F6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SGO2Q562F6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SGO2Q562F6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SGO2Q562F6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SGO2Q562F6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SGO2Q562F6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SGO2Q562F6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SGO2Q562F6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SGO2Q562F6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SGO2Q562F6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SGO2Q562F6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SGO2Q562F6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SGO2Q562F6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SGO2Q562F6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SGO2Q562F6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SGO2Q562F6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SGO2Q562F6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SGO2Q562F6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SGO2Q562F6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SGO2Q562F6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SGO2Q562F6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SGO2Q562F6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SGO2Q562F6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SGO2Q562F6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SGO2Q562F6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SGO2Q562F6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SGO2Q562F6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SGO2Q562F6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SGO2Q562F6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SGO2Q562F6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SGO2Q562F6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SGO2Q562F6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SGO2Q562F6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SGO2Q562F6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SGO2Q562F6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SGO2Q562F6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SGO2Q562F6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SGO2Q562F6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SGO2Q562F6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SGO2Q562F6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SGO2Q562F6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SGO2Q562F6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SGO2Q562F6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SGO2Q562F6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SGO2Q562F6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SGO2Q562F6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SGO2Q562F6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SGO2Q562F6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SGO2Q562F6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SGO2Q562F6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SGO2Q562F6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SGO2Q562F6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SGO2Q562F6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SGO2Q562F6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SGO2Q562F6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SGO2Q562F6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SGO2Q562F6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SGO2Q562F6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SGO2Q562F6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SGO2Q562F6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SGO2Q562F6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SGO2Q562F6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SGO2Q562F6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SGO2Q562F6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SGO2Q562F6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SGO2Q562F6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109 ms