Protein–RNA interactions for Protein: Q53H64

LINC00483, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00483, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00483Q53H64 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00483Q53H64 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00483Q53H64 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00483Q53H64 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00483Q53H64 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00483Q53H64 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00483Q53H64 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00483Q53H64 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00483Q53H64 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00483Q53H64 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00483Q53H64 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00483Q53H64 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00483Q53H64 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00483Q53H64 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00483Q53H64 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00483Q53H64 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00483Q53H64 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00483Q53H64 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00483Q53H64 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00483Q53H64 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00483Q53H64 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00483Q53H64 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00483Q53H64 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00483Q53H64 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00483Q53H64 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00483Q53H64 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00483Q53H64 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00483Q53H64 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00483Q53H64 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00483Q53H64 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00483Q53H64 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00483Q53H64 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00483Q53H64 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00483Q53H64 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00483Q53H64 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00483Q53H64 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00483Q53H64 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00483Q53H64 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00483Q53H64 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00483Q53H64 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00483Q53H64 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00483Q53H64 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00483Q53H64 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00483Q53H64 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00483Q53H64 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00483Q53H64 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00483Q53H64 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00483Q53H64 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00483Q53H64 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00483Q53H64 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00483Q53H64 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00483Q53H64 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00483Q53H64 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00483Q53H64 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00483Q53H64 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00483Q53H64 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00483Q53H64 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00483Q53H64 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00483Q53H64 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00483Q53H64 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00483Q53H64 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00483Q53H64 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00483Q53H64 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00483Q53H64 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00483Q53H64 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00483Q53H64 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00483Q53H64 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00483Q53H64 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00483Q53H64 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00483Q53H64 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00483Q53H64 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00483Q53H64 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00483Q53H64 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00483Q53H64 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00483Q53H64 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00483Q53H64 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00483Q53H64 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00483Q53H64 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00483Q53H64 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00483Q53H64 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00483Q53H64 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00483Q53H64 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00483Q53H64 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00483Q53H64 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00483Q53H64 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00483Q53H64 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00483Q53H64 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00483Q53H64 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00483Q53H64 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00483Q53H64 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00483Q53H64 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00483Q53H64 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00483Q53H64 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00483Q53H64 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00483Q53H64 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00483Q53H64 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00483Q53H64 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00483Q53H64 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00483Q53H64 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00483Q53H64 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms