Protein–RNA interactions for Protein: Q53EV4

LRRC23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC23Q53EV4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC23Q53EV4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC23Q53EV4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC23Q53EV4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC23Q53EV4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC23Q53EV4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC23Q53EV4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC23Q53EV4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC23Q53EV4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC23Q53EV4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC23Q53EV4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC23Q53EV4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC23Q53EV4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC23Q53EV4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC23Q53EV4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC23Q53EV4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC23Q53EV4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC23Q53EV4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC23Q53EV4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC23Q53EV4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC23Q53EV4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC23Q53EV4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC23Q53EV4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC23Q53EV4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC23Q53EV4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC23Q53EV4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC23Q53EV4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC23Q53EV4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC23Q53EV4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC23Q53EV4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC23Q53EV4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC23Q53EV4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC23Q53EV4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC23Q53EV4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC23Q53EV4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC23Q53EV4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC23Q53EV4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC23Q53EV4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC23Q53EV4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC23Q53EV4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC23Q53EV4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC23Q53EV4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC23Q53EV4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC23Q53EV4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC23Q53EV4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC23Q53EV4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC23Q53EV4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC23Q53EV4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC23Q53EV4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC23Q53EV4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC23Q53EV4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC23Q53EV4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC23Q53EV4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC23Q53EV4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC23Q53EV4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC23Q53EV4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC23Q53EV4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC23Q53EV4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC23Q53EV4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC23Q53EV4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC23Q53EV4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC23Q53EV4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC23Q53EV4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC23Q53EV4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC23Q53EV4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC23Q53EV4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC23Q53EV4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC23Q53EV4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC23Q53EV4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC23Q53EV4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC23Q53EV4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC23Q53EV4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC23Q53EV4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC23Q53EV4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRRC23Q53EV4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC23Q53EV4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC23Q53EV4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC23Q53EV4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC23Q53EV4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC23Q53EV4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC23Q53EV4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC23Q53EV4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC23Q53EV4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC23Q53EV4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC23Q53EV4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC23Q53EV4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC23Q53EV4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC23Q53EV4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC23Q53EV4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC23Q53EV4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC23Q53EV4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC23Q53EV4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC23Q53EV4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC23Q53EV4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC23Q53EV4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC23Q53EV4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC23Q53EV4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC23Q53EV4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC23Q53EV4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC23Q53EV4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms